Table 1

Read Statistics

Btau 1.0

Btau 2.0

Btau 3.1

Btau 4.0

InsertSize(kb)

2 to 4

4 to 6

2 to 4

4 to 6

2 to 6

200

2 to 6

200

Source/Vector

Plasmid

Plasmid

Plasmid

Plasmid

Plasmid

BAC

Plasmid

BAC


Reads (million)

WGS

All WGS

14.09

1.41

NA

NA

26.98

0.21

26.98

0.21

Total

15.51

27.2

27.19

27.19

Trimmed

11.72

1.15

19

4

23.09

0.17

23.09

0.17

Total

12.88

23

23.26

23.26

Paired

11.01

1.07

5

5.2

NA

NA

NA

NA

Total

12.08

10.2

NA

NA

Assembled

8.98

0.89

14.9

3.2

18.74

0.11

18.74

0.11

Total

9.87

18.1

18.86

18.86

Unassembled

0.39

0.04

0.31

0.06

NA

NA

NA

NA

Total

0.43

0.37

NA

NA

Single BACs

All

NA

NA

NA

NA

6.42

NA

6.42

NA

Total

NA

NA

6.42

6.42

Trimmed

NA

NA

NA

NA

5.11

NA

5.11

NA

Total

NA

NA

5.11

5.11

Assembled

NA

NA

NA

NA

4.28

NA

4.28

NA

Total

NA

NA

4.28

4.28

Pooled BACs

All

NA

NA

NA

NA

5.38

NA

5.38

NA

Total

NA

NA

5.38

5.38

Trimmed

NA

NA

NA

NA

5.12

NA

5.12

NA

Total

NA

NA

5.12

5.12

Assembled

NA

NA

NA

NA

2.92

NA

2.92

NA

Total

NA

NA

2.92

2.92


Liu et al. BMC Genomics 2009 10:180   doi:10.1186/1471-2164-10-180

Open Data