<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML">
<mml:mtable> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>P</mml:mi>
<mml:mi>I</mml:mi>
<mml:mi>R</mml:mi>
<mml:mi>S</mml:mi>
<mml:mi>F</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>1</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mtext>if&#160;g</mml:mtext>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mtext>&#160;is&#160;annotated&#160;onto&#160;at&#160;least&#160;one</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mtext>&#8195;</mml:mtext>
<mml:mtext>&#160;protein&#160;family&#160;that&#160;disease&#160;genes&#160;enriched;</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>0</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mtext>otherwise;</mml:mtext>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>K</mml:mi>
<mml:mi>E</mml:mi>
<mml:mi>G</mml:mi>
<mml:mi>G</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>1</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mtext>if&#160;g</mml:mtext>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mtext>&#160;is&#160;annotated&#160;onto&#160;at&#160;least&#160;one</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mtext>&#160;</mml:mtext>
<mml:mtext>&#8195;</mml:mtext>
<mml:mtext>KEGG&#160;pathway&#160;that&#160;disease&#160;genes&#160;enriched;</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>0</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mtext>otherwise;</mml:mtext>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>G</mml:mi>
<mml:mi>O</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>1</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mtext>if&#160;g</mml:mtext>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mtext>&#160;is&#160;annotated&#160;onto&#160;at&#160;least&#160;one</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mtext>&#160;</mml:mtext>
<mml:mtext>&#8195;</mml:mtext>
<mml:mtext>GO&#160;term&#160;that&#160;disease&#160;genes&#160;enriched;</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>0</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mtext>otherwise;</mml:mtext>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>P</mml:mi>
<mml:mi>I</mml:mi>
<mml:mi>R</mml:mi>
<mml:mi>S</mml:mi>
<mml:mi>F</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>&#8744;</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>G</mml:mi>
<mml:mi>O</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>&#8744;</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>K</mml:mi>
<mml:mi>E</mml:mi>
<mml:mi>G</mml:mi>
<mml:mi>G</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>1</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mi>f</mml:mi>
<mml:mtext>&#160;</mml:mtext>
<mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mtext>&#160;is&#160;defined&#160;as&#160;a&#160;candidate;</mml:mtext>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>0</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mtext>otherwise</mml:mtext>
<mml:mtext>.</mml:mtext>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:math>