Table 2

Overview of all chromosomal gains and losses detected in the gastric cancer cell line IPA220.

Gains

Losses

Cytoband

Start (bp)

Segment size (Mb)

Cytoband

Start (bp)

Segment size (Mb)


1p33-1p36.33

1532086

45.95

1p33-1p33

48905659

0.05

1p22.3-1p22.3

85435027

0.06

2q22.1-2q11.1

95057834

45.61

2q33.1-2q33.1

200167066

0.43

3p26.3-3p22.1

224727

40.68

4p16.3-4p16.3

62447

1.83

4q13.3-4q13.1

60036497

14.87

5p12-5p15.33

148243

43.37

5q33.2-5q31.3

141986337

12.82

6p25.3-6p25.3

204528

0.03

6p12.3-6p21.1

43716420

5.79

6q12-6p12.1

56790132

12.18

6q27-6q14.1

80423355

90.39

7p22.3-7p22.1

149268

4.55

7p21.1-7p22.1

4874872

14.88

7q34-7p12.1

53246250

86.37

8p23.3-8p11.21

181530

42.99

8q24.3-8q11.1

47062121

99.19

9q34.2-9q34.3

133008166

5.28

10p15.3-10p13

138206

16.20

10p12.33-10p13

16543648

1.39

10q11.22-10p11.22

33177446

13.39

10q11.23-10q11.23

51219561

0.04

10q21.1-10q22.1

53701099

18.43

10q22.1-10q22.1

74316662

0.24

10q22.1-10q22.2

74569446

0.95

10q22.2-10q22.2

75567726

0.57

10q22.2-10q22.2

76194936

0.41

10q22.2-10q24.2

77212707

23.02

10q26.3-10q26.3

133641790

1.65

11p14.1-11p15.5

2389958

27.82

11p12-11p11.12

39023903

11.61

11q13.1-11q13.1

65527252

0.02

11q14.3-11q14.3

88320337

0.38

11q22.3-11q23.3

103942362

13.29

11q23.3-11q25

117574530

16.38

12p13.33-12p13.33

1471571

0.32

13q21.31-13q12.13

24807238

37.57

14q24.3-14q24.3

74237320

1.26

14q32.33-14q32.33

103705675

2.24

16p13.3-16p13.3

258880

1.09

16q12.2-16q12.1

48880404

2.95

16q12.2-16q22.1

53523174

12.50

16q22.1-16q24.3

66132070

22.52

17q21.31-17q21.31

41566540

0.06

18q11.2-18p11.22

10662792

7.80

18q11.2-18q11.2

20896260

0.38

18q23-18q11.2

21531881

53.70

18q23-18q23

75803559

0.28

19p13.3-19p13.3

232080

0.75

19q13.12-19q12

34074193

6.56

20p11.21-20p11.22

21329267

4.35

20q13.33-20q11.21

29352138

33.01

21q21.1-21q11.2

13926078

6.84

21q22.3-21q22.3

45354820

1.07

22q11.22-22q11.1

14433473

7.35

22q12.1-22q11.23

23692593

2.23

22q12.1-22q13.1

26016519

10.56

22q13.1-22q13.1

37683612

0.03

22q13.33-22q13.31

44867938

3.71


Buffart et al. BMC Medical Genomics 2009 2:39   doi:10.1186/1755-8794-2-39

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