Table 1

Overview of all chromosomal gains and losses detected in the gastric cancer cell line GP202

Gains

Losses

Cytoband

Start (bp)

Segment size (Mb)

Cytoband

Start (bp)

Segment size (Mb)


1p36.33-1p36.32

604268

3.10

1p36.21-1p35.1

14554092

18.26

1p32.3-1p31.2

51415638

17.20

1p31.1-1p31.1

75490653

3.21

1p31.1-1p22.3

84414481

2.76

1p22.2-1p13.3

91093183

19.83

1q24.3-1q44

167792143

77.63

2p25.3-2p23.3

29193

24.75

2p23.1-2p22.2

30171297

7.64

2p22.2-2p22.1

38068378

1.57

2p22.1-2p21

39804095

2.17

2p21-2p21

42322892

1.85

2p21-2p16.2

44568947

8.24

2p12-2p12

75641228

7.06

2q14.1-2q14.1

114390667

2.40

2q24.1-2q24.1

155514824

1.07

2q24.3-2q24.3

166690618

1.25

2q32.1-2q32.2

184949202

4.73

3p26.3-3p11.1

224727

87.69

3q11.2-3q11.2

95295727

3.77

3q12.1-3q12.2

100024301

1.70

3q22.3-3q24

140145815

8.85

3q24-3q25.1

149729642

3.28

3q25.2-3q26.1

156397505

6.15

3q26.1-3q26.1

162557800

6.25

3q26.2-3q26.31

170346051

4.88

3q26.32-3q29

177640401

20.35

4p16.3-4q35.2

62447

191.20

5p15.33-5p14.1

148243

29.04

5p13.3-5p12

30636882

13.08

5q11.2-5q12.1

50714334

8.21

5q12.3-5q14.2

65345185

17.43

5q31.3-5q31.3

143269803

1.01

5q33.3-5q34

158674495

4.67

6p21.2-6p21.2

38554812

0.15

6p12.1-6p12.1

54055870

2.14

6p11.2-6q13

58122432

12.68

6q15-6q16.1

91282705

5.81

6q16.3-6q21

101156415

4.21

6q24.3-6q24.3

147629943

0.12

6q25.2-6q25.3

155542493

0.97

6q25.3-6q27

156677778

14.13

7p21.3-7p14.1

8408484

33.10

7p11.2-7p11.2

54921296

0.57

7q11.21-7q11.22

65833193

4.96

7q11.23-7q11.23

76818583

0.16

7q21.13-7q31.1

90482514

19.64

7q31.1-7q31.1

110637986

1.28

7q31.1-7q31.2

113074003

2.15

7q31.33-7q31.33

124912671

0.76

7q34-7q35

142863066

0.23

7q35-7q36.3

147112584

11.48

8p23.3-8p23.1

181530

11.15

8p23.1-8p11.21

12627630

29.40

8p11.21-8q21.3

42137357

49.48

8q22.1-8q22.3

95005574

9.49

8q24.11-8q24.3

117851748

28.40

9p24.3-9p24.2

204367

3.94

9p23-9p22.3

9335062

5.76

9p21.1-9p21.1

28203365

2.53

9q13-9q21.13

68264900

4.61

9q21.13-9q21.31

74400503

5.06

9q21.33-9q22.1

85372508

2.87

9q22.2-9q22.31

89232280

2.91

9q22.31-9q22.32

93160028

1.30

9q22.33-9q31.1

97586481

3.58

9q31.1-9q31.1

104314825

0.46

9q31.3-9q32

110265680

3.46

9q33.1-9q33.2

115059550

7.40

9q33.2-9q33.3

122895073

0.42

9q33.3-9q34.11

126436029

3.69

10p15.3-10p11.22

138206

34.13

10q21.1-10q26.3

54480789

80.81

11p11.2-11p11.2

43422214

1.84

11q12.1-11q13.4

57256449

13.13

11q14.3-11q14.3

87970040

0.76

11q14.3-11q14.3

89525497

0.05

11q21-11q22.1

96058479

3.39

12q12-12q22

37052371

55.79

12q23.1-12q23.3

96894351

6.93

12q24.23-12q24.23

117761811

0.61

12q24.31-12q24.31

121971290

1.03

12q24.31-12q24.33

123020939

9.36

13q12.2-13q13.1

27392825

5.14

13q13.3-13q21.33

34631933

36.49

13q31.1-13q31.3

79911534

13.43

14q11.2-14q11.2

19365051

2.79

14q11.2-14q12

22545671

6.72

14q13.3-14q21.1

36741208

0.35

14q21.1-14q21.2

40137052

3.71

14q21.2-14q21.3

45739681

3.13

14q31.1-14q32.33

78503451

27.83

15q11.2-15q24.1

19109124

52.29

15q24.1-15q26.3

71444303

28.72

16p13.3-16p13.3

1339391

3.35

16p13.3-16p12.3

5565717

13.83

16p12.3-16p12.3

19426488

0.04

16p12.3-16q21

19493912

38.95

16q22.1-16q22.1

66730760

1.00

16q22.1-16q23.1

67757442

9.01

16q23.1-16q24.3

77573211

11.08

17p13.3-17p13.1

48539

7.48

17q11.1-17q11.2

22335103

1.75

18p11.32-18q12.1

170229

30.01

18q12.3-18q23

36319629

39.76

19p13.3-19q12

232080

33.93

19q12-19q13.31

36336102

12.74

19q13.32-19q13.32

52132977

0.56

20p13-20p12.1

18580

14.51

20p12.1-20p12.1

14772372

1.30

20p11.21-20q13.33

24262140

38.10

21q21.1-21q21.3

17434961

11.95

21q21.3-21q22.3

29452714

16.38


Buffart et al. BMC Medical Genomics 2009 2:39   doi:10.1186/1755-8794-2-39

Open Data