Table 3

The pre-miRNAs whose arm selection preferences are not consistent with the miRBase annotation.

pre-miRNA

Location

N1

N2

N3

T1

T2


hsa-mir-30c-2

MA:7-29;mi:47-68

-

Y

Y

Y

-

hsa-mir-30b

MA:17-38;mi:55-76

Y

Y

Y

-

-

hsa-mir-126

mi:15-35;MA:52-73

Y

-

Y

Y

-

hsa-mir-106b

MA:12-32;mi:52-73

Y

-

Y

Y

-

hsa-mir-377

mi:7-28;MA:45-66

Y

Y

Y

Y

-

hsa-mir-382

5p:11-32

Y

Y

Y

Y

-

hsa-mir-511-1

5p:16-36

Y

Y

Y

-

-

hsa-mir-193b

mi:14-35;MA:51-72

Y

Y

Y

-

-

hsa-mir-500a

MA:13-35;mi:52-73

Y

Y

Y

Y

Y

hsa-mir-505

mi:15-36;MA:51-72

Y

Y

Y

-

Y

hsa-mir-548h-3

5p:29-50

Y

Y

Y

Y

Y

hsa-mir-664

mi:11-34;MA:49-71

Y

Y

Y

Y

Y

hsa-mir-1307

3p:80-101

Y

Y

Y

Y

Y


'Y' indicates that the major-to-minor arm switch event was observed in the corresponding library; while '-' means "not observed". N1, N2, N3, T1 and T2 denote the SRX018957, SRX018958, SRX018959, SRX018965 and SRX018967 libraries, respectively.

Li et al. BMC Systems Biology 2012 6(Suppl 2):S14   doi:10.1186/1752-0509-6-S2-S14

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