Table 3

Parameter inference result for auto-regulatory gene network model (Partially observed case)

Datasets

k1

k2

k3

k4

k5

k6

k7

k8

Average % Err.

*(0.1

0.7

0.35

0.3

0.1

0.9

0.2

0.1)


0.102

0.47

0.44

0.214

0.040

0.326

0.400

0.156

46.1

0.090

0.70

0.440

0.348

0.052

0.483

0.263

0.119

24.6

0.125

0.91

0.402

0.316

0.077

0.78

0.230

0.097

16.2

0.188

0.64

0.413

0.250

0.072

0.64

0.43

0.196

49.9

0.078

0.76

0.350

0.300

0.103

0.88

0.188

0.097

5.6


0.108

0.41

0.303

0.247

0.131

0.955

0.214

0.107

16.5

0.079

0.56

0.383

0.332

0.073

0.82

0.228

0.099

14.0

0.123

0.41

0.55

0.386

0.079

0.87

0.213

0.085

24.5

0.103

0.81

0.419

0.421

0.102

1.04

0.142

0.097

16.0

0.075

0.75

0.37

0.30

0.13

0.96

0.25

0.11

13.7


* True values

Datasets D1*-D10* correspond to D1-D10 in Table 3 but with speices mRNA, P and P2 only.

Average % Err. ≡ ⟨|ki - ki, true|/ki, truei

Wang et al. BMC Systems Biology 2010 4:99   doi:10.1186/1752-0509-4-99

Open Data