Table 1

Results (threshold cycle values) of real-time PCR obtained from suspected clinical samples
Identification number Nasal swab Ocular swab Rectal swab Blood Crusted scab Lung nodule
TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay
(Ct value) (Ct value) (Ct value) (Ct value) (Ct value) (Ct value)
1 (outbreak n° 1) 25,93 25,97 30,83 36,2 19,88 -
2 (outbreak n° 1) 27,57 27,8 32,77 38 22,88 -
3 (outbreak n° 1) 29,12 31,08 28,32 37,6 - -
4 (outbreak n° 1) 30,28 30,83 40,03 30,75 - -
5 (outbreak n° 1) 31,97 32,8 35 39,87 19,59 -
6 (outbreak n° 1) 38,33 26,07 38,93 37,78 - -
7 (outbreak n° 1) 25,82 39,75 33,6 33,42 - -
8 (outbreak n° 1) No Ct 42,5 No Ct - - 18,7
9 (outbreak n° 1) 39,93 No Ct 39,21 37,1 - -
10 (outbreak n° 1) 38,3 22,97 30,32 37,8 - -
11 (outbreak n° 1) 24,03 24,5 37,17 40,93 20,98 -
12 (outbreak n° 1) 21,56 35,95 No Ct - - 17,95
13 (outbreak n° 2) 35,07 33,25 38,78 41,1 - -
14 (outbreak n° 2) 29,8 28,83 No Ct 36,5 - -
15 (outbreak n° 2) 30,69 34,64 42,5 30,29 - -
16 (outbreak n° 3) 36,64 31,21 35,6 No Ct - -
17 (outbreak n° 3) 34 29,86 36,04 No Ct - -
18 (outbreak n° 3) 29,7 33,5 38,75 - - 19,93
19 (outbreak n° 3) 34,2 33,93 34,93 40,75 - -
20 (outbreak n° 3) 33,92 36,33 38,2 36,4 -
21 (outbreak n° 4) 35,07 37,9 39,5 33,96 -
22 (outbreak n° 4) 40,48 40,16 41,1 - - 20,37
23 (outbreak n° 4) 41,7 35,87 35,1 No Ct - -
24 (outbreak n° 4) 40,16 35,83 34,83 38,04 - -
25 (outbreak n° 4) 35,66 33,3 39,5 35,86 - -
26 (outbreak n° 5) No Ct 33,95 35,32 No Ct - -
27 (outbreak n° 5) 37,5 31,39 40,3 40,68 - -
28 (outbreak n° 5) 33,96 30,42 39,5 - - 22,94
29 (outbreak n° 6) 27,5 27,5 38 No Ct - -
30 (outbreak n° 6) 40 27,18 39,5 40,67 - -
31 (outbreak n° 6) 24,58 22,28 38 No Ct - -
32 (outbreak n° 6) 19,39 26,8 29,89 39,48 - -
33 (outbreak n° 7) 28,79 22 26,62 33,84 - -

-° : sampling unrealized.

Zro et al.

Zro et al. BMC Veterinary Research 2014 10:31   doi:10.1186/1746-6148-10-31

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