Table 9

SOM predictions for the proteins with unknown function in structural genomics
PDB (Ligand) SOM ETA
1h2hA (NAD) 1.3.1.26 1.4.1, 4.3.1
1npdA (NAD) 1.14.99.3 1.1.1, 5.4.99
1o61A (PLP) 2.1.1.104 2.6.1, 6.3.4
1o8cA (NDP) 1.1.1.2 2.3.3, 5.4.4, 6.3.2
1rljA (FMN) 1.8.1.2 2.4.1
1t57A (FMN) 1.8.1.9 3.2.1
1ue8A (HEM) 1.2.1.9 1.14.14, 2.3.2, 2.7.7, 3.5.4, 3.6.1, 4.2.99, 5.1.3
1ve3A (SAM) 2.1.1.104 2.1.1, 3.1.3
1ve3B (SAM) 2.6.1.1 2.1.1, 3.1.3, 3.5.3, 5.1.3
1xq6A (NAP) 1.2.4.4 1.6.5
1y81A (COA) 2.3.1.85 1.13.11, 2.3.2, 2.7.10, 2.8.1, 3.6.1, 3.6.3, 4.1.2, 4.3.1, 6.3.2
1yoaA (FAD) 1.3.1.24 1.5.1.30 1.3.1, 1.6.8, 2.7.4, 3.4.21, 3.7.1
1yreD (COA) 2.1.1.79 1.1.1, 2.3.1, 3.4.11, 3.4.22, 4.2.99
2e6uX (COA) 2.5.1.18 3.5.1
2eisA (COA) 2.5.1.6 3.1.2
2gluA (SAM) 2.3.1.168 2.1.1, 3.4.24
2gqfA (FAD) 1.3.1.26 1.1.1, 1.18.6, 1.3.3, 1.7.1, 2.7.1, 2.7.7, 3.2.1, 3.3.2, 3.4.21, 4.1.1, 6.3.3, 6.3.5
2gswA (FMN) 1.18.1.2 1.5.1, 1.7.1, 3.1.4
2ptfA (FMN) 1.8.1.7 1.14.13
2q46A (NAP) 1.2.4.4 1.6.5
3cgvA (FAD) 1.14.14.1 2.4.1, 6.1.1
3dmeB (FAD) 1.18.1.2 3.5.2
3f2vA (FMN) 1.6.5.2, 1.6.99.2 1.10.99

The EC numbers compatible with the bound ligands are shown in bold font.

Ueno et al.

Ueno et al. BMC Structural Biology 2012 12:5   doi:10.1186/1472-6807-12-5

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