Table 5

Ribosomal reporters identified in an unknown isolate (Y. pseudotuberculosis) and their predicted conservation within the prokaryotes

Reporter

Enterobacter

Erwinia

Escherichia

Haemophilus

Pasteurella

Photorhabdus

Salmonella

Shewenella

Shigella

Yersinia

Vibrio

Family

E

E

E

P

P

E

E

S

E

E

V

Hi09070800

Y

Y

Y

Y

Vc25052592

Y

Y

Y

Y

Y

Y

Y

Vc25060290

Y

Y

Y

Yp58100052

Y

Y

Y

Y

Y

Y

Yp58100112

Y

Yp58100200

Y

Y

Y

Yp58100206

Y

Y

Y

Y

Y

Y

Y

Yp58100214

Y

Y

Yp58100215

Y

Y

Y

Yp58100233

Y

Y

Y

Y

Y

Y

Y

Yp58100797

Y

Total (44)

5

5

5

1

1

2

6

1

5

11

2

E = Enterobacteriaceae, P = Pasteurellaceae, S = Shewenallaaceae, V = Vibrionaceae, Y = reporter identified in at least one species from that genera by BLAST analysis.

Stabler et al. BMC Microbiology 2008 8:177   doi:10.1186/1471-2180-8-177