Table 4

MLVA genotypes resolved by the MLVA-6 scheme

MLVA

Genotypes

Allelic

Profile

Total

(189)

Origin of strains (No. of strains)

STs

(No. of strains)

Serotypes


Vaginal carriage

(71)

Gastric fluid

(5)

Blood

(17)

Cerebral-spinal fluid

(59)

Bovine

(34)

Ref

(3)


1

3,2,1,8,14,5

5

2

1

-

-

1

1

ST-7

Ia (4), IV

2

4,3,2,0,5,5

1

-

-

-

1

-

-

ST-23

Ia

3

4,3,1,0,11,5

1

-

-

-

1

-

-

ST-23

Ia

4

4,3,1,5,11,5

1

-

-

-

1

-

-

ST-23

Ia

5

3,2,3,10,5,5

1

1

-

-

-

-

-

ST-314

Ia

6

3,3,1,6,16,6

3

2

-

1

-

-

-

ST-10 (2), ST-41

Ia, II, V

7

4,3,1,5,11,2

1

1

-

-

-

-

-

ST-23

Ia

8

4,3,3,10,14,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-1

V

9

3,3,1,10,9,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-304

Ib

10

3,3,1,7,14,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-10

Ib

11

3,3,1,6,12,3

2

1

-

1

-

-

-

ST-10

Ib

12

3,3,1,6,14,3

2

1

-

1

-

-

-

ST-8, ST-12

Ib

13

3,3,1,6,8,6

1

-

-

1

-

-

-

ST-12

Ib

14

3,3,1,6,14,6

2

1

-

1

-

-

-

ST-12, ST-200

Ib

15

3,3,1,10,6,3

1

-

-

-

1

-

-

ST-6

Ib

16

3,3,3,6,14,3

2

1

-

-

1

-

-

ST-8, ST-196

Ib, IV

17

3,3,1,6,6,6

1

-

-

-

1

-

-

ST-10

Ib

18

3,3,1,10,10,4

2

1

-

-

1

-

-

ST-6, ST-195

Ib, III

19

3,3,1,6,10,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-10

Ib

20

3,3,1,6,10,6

1

1

-

-

-

-

-

ST-12

Ib

21

3,2,1,5,14,6

1

1

-

-

-

-

-

ST-10

Ib

22

3,3,6,15,4,3

1

-

-

-

-

1

-

ST-301

II

23

3,3,6,10,2,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-313

II

24

3,3,6,15,4,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-301

II

25

3,2,4,24,5,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-226

II

26

3,2,1,10,4,5

1

-

-

-

-

1

-

ST-63

II

27

3,3,1,6,0,6

2

1

-

-

-

1

-

ST-2

II

28

3,3,6,15,2,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-64

II

29

3,3,1,6,0,5

1

-

1

-

-

-

-

ST-2

II

30

2,3,6,0,3,5

1

-

-

1

-

-

-

ST-22

II

31

2,2,5,0,3,5

1

1

-

-

-

-

-

ST-22

II

32

3,3,1,5,0,2

3

3

-

-

-

-

-

ST-28

II

33

3,3,3,5,0,2

11

8

-

1

2

-

-

ST-19 (9), ST-131, ST-408

II (3), III (7), V

34

3,3,1,5,6,2

1

1

-

-

-

-

-

ST-28

II

35

3,3,1,6,6,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-12

II

36

3,2,1,7,16,6

1

1

-

-

-

-

-

ST-10

II

37

2,3,1,0,19,1

1

-

-

-

-

1

-

ST-305

III

38

3,3,1,0,17,1

1

-

-

-

-

1

-

ST-23

III

39

3,3,3,5,14,2

1

-

-

-

-

1

-

ST-19

III

40

3,3,1,0,7,5

2

-

-

1

-

1

-

ST-199, ST-307

III

41

3,3,1,0,14,5

1

-

-

-

-

1

-

ST-311

III

42

3,3,1,0,26,5

1

-

-

-

-

1

-

ST-23

III

43

3,2,1,0,2,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-309

III

44

3,3,6,0,2,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-310

III

45

3,3,6,0,5,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-61

III

46

2,2,2,10,6,3

32

7

1

2

22

-

-

ST-17 (30), ST-201

III (31), NT

47

2,2,2,10,8,3

13

6

-

1

6

-

-

ST-17 (12), ST-315

III

48

3,3,3,6,0,2

4

2

-

1

-

-

1

ST-19 (3), ST-110

III (3), V

49

3,3,1,0,5,4

1

-

-

1

-

-

-

ST-198

III

50

3,3,1,0,20,5

1

-

-

1

-

-

-

ST-23

III

51

2,2,2,10,3,3

6

2

-

-

4

-

-

ST-17

III

52

2,2,2,5,5,3

1

-

-

-

1

-

-

ST-17

III

53

2,2,2,10,5,3

3

1

-

-

2

-

-

ST-17

III

54

2,2,2,9,6,3

1

-

-

-

1

-

-

ST-17

III

55

2,2,2,10,7,3

1

-

-

-

1

-

-

ST-17

III

56

2,2,2,6,8,3

1

-

-

-

1

-

-

ST-17

III

57

3,3,3,5,6,2

7

-

-

-

7

-

-

ST-19

III

58

3,3,3,6,6,2

1

-

-

-

1

-

-

ST-19

III

59

3,3,3,5,11,2

1

-

-

-

1

-

-

ST-19

III

60

3,3,1,0,10,5

1

-

-

-

1

-

-

ST-23

III

61

3,3,1,0,18,2

1

-

-

-

-

-

1

ST-23

III

62

2,2,2,10,8,2

1

1

-

-

-

-

-

ST-17

III

63

3,3,3,7,2,2

1

1

-

-

-

-

-

ST-27

III

64

3,3,3,5,3,2

1

1

-

-

-

-

-

ST-19

III

65

3,3,2,5,6,2

2

2

-

-

-

-

-

ST-19

III

66

3,3,1,0,27,2

1

1

-

-

-

-

-

ST-366

III

67

3,3,3,10,7,3

2

2

-

-

-

-

-

ST-1

V

68

3,3,3,5,15,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-19

III

69

3,3,1,0,24,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-23

III

70

3,3,3,5,0,4

1

1

-

-

-

-

-

ST-107

III

71

3,3,3,0,7,4

1

-

-

-

1

-

-

ST-196

IV

72

3,3,3,0,10,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-2

IV

73

3,3,3,6,15,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-196

IV

74

2,2,1,8,5,1

1

-

-

-

-

1

-

ST-302

NT

75

3,3,6,15,7,2

2

-

-

-

-

2

-

ST-61

NT

76

3,3,5,8,2,3

1

-

-

-

-

1

-

ST-67

NT

77

3,3,6,0,4,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-301

NT

78

3,3,5,8,4,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-67

NT

79

3,3,3,9,4,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-85

NT

80

3,2,1,8,5,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-300

NT

81

3,2,1,8,10,4

1

-

-

-

-

1

-

ST-303

NT

82

3,3,3,10,0,6

2

-

-

-

-

2

-

ST-250

NT

83

3,3,3,0,4,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-312

NT

84

3,3,3,10,6,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-250

NT

85

3,3,3,10,0,7

1

-

-

-

-

1

-

ST-306

NT

86

3,3,3,6,18,2

1

-

1

-

-

-

-

ST-197

NT

87

3,3,3,10,11,3

2

-

-

1

1

-

-

ST-1

NT, V

88

3,3,3,10,28,3

3

2

-

1

-

-

-

ST-1, ST-186

NT, V

89

3,3,3,10,40,3

1

-

-

1

-

-

-

ST-2

NT

90

3,3,3,6,5,2

1

1

-

-

-

-

-

ST-19

NT

91

3,3,2,10,19,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-1

V

92

3,3,2,0,7,6

1

-

-

-

-

1

-

ST-26

V

93

3,3,3,0,16,3

1

-

1

-

-

-

-

ST-202

V

94

3,2,3,10,7,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-1

V

95

3,3,3,10,26,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-1

V

96

3,3,3,10,30,3

1

1

-

-

-

-

-

ST-1

V

97

3,3,3,10,35,5

1

1

-

-

-

-

-

ST-1

V

98

3,3,2,0,24,6

1

1

-

-

-

-

-

ST-26

V


Each MLVA genotype is expressed as its allelic profile, corresponding to the number of repeats at each VNTR (SAG2, SAG3, SAG4, SAG7, SAG21 and SAG22)

Haguenoer et al. BMC Microbiology 2011 11:171   doi:10.1186/1471-2180-11-171

Open Data