Table 4

Mas Homologs in Selected Actinomycetales Genomesab

Rv

ML

MAP

MSMEG

nfa

SAV

SCO


Mas1 A

0175 (213)

2595 (182)

3610 (213)

0134 (202)

B

0176 (322)

2596 (325)

3611 (323)

0135 (288)

C

0177 (184)

2597 (184)

3612 (184)

0136 (182)

D

0178 (244)

2598 (184)

3613 (252)

0137 (296)


Mas3 A

1972 (191)

2110c (203)

0343 (200)

B

1973 (160)

2109/7cc

0344 (202)


Mas4 A

3493c (242)

0570 (243)

5857 (233)

5430 (315)

B

3492c (160)

0571 (164)

5856 (161)

5440 (162)


Mas6 A

51010 (248)

5893 (177)

2413 (170)

B

51000 (274)

5892 (272)

2412 (219)

C

2411 (184)

D

2410 (253)


Mas7-1 A

0114 (198)

1139 (230)

50460 (246)

Mas7-2 A

1857 (227)

56250 (321)


ClusterI A

1363c (261)

0751c (295)

4759.2 (303)

B

1362c (220)

0750c (187)

4759 (200)

A

0768c (298)

2867 (190)

B

0767c (224)

2868 (218)


ClusterII A

0199 (219)

2614 (229)

0225 (206)

6070 (197)

B

0200 (229)

2615 (224)

0226 (229)


A

2390c (185)

0090c (212)


A

0878 (167)

B

0879 (496)


A

5189 (231)

B

5190 (192)


a Organism specific gene number prefix: Rv, M. tuberculosis H37Rv; ML, M. leprae; MAP, M. paratuberculosis; MSMEG, M. smegmatis; nfa, N. farcinica; SCO, S. coelicolor; SAV, S. avermitilis.

b Each row contains putative orthologs. Length of protein in amino acids shown in parentheses.

c ORF is interrupted by a transposase, MAP2108.

Casali and Riley BMC Genomics 2007 8:60   doi:10.1186/1471-2164-8-60

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