Table 1

Measure of migration prediction accuracy for all profiles


Human NotI-EcoRV-HinfI (n = 795)
 Human AscI-EcoRV-HinfI (n = 133)
 Mouse NotI-EcoRV-HinfI (n = 530)
Func
Median
 Mean
 RMSc
 90%d
 90%-RMS
 Median
 Mean
 RMS
 90%
 90%-RMS
 Median
 Mean
 RMS
 90%
 90%-RMS
(1)a
 X
 0.17b
 0.22
 0.28
 0.45
 0.20
 0.14
 0.25
 0.44
 0.52
 0.19
 0.35
 0.49
 0.99
 0.79
 0.35
(2)
 X
 0.14
 0.17
 0.23
 0.34
 0.16
 0.13
 0.23
 0.55
 0.34
 0.14
 0.15
 0.23
 0.76
 0.36
 0.17
(3)
 X
 0.13
 0.15
 0.20
 0.31
 0.14
 0.12
 0.13
 0.17
 0.26
 0.13
 0.11
 0.18
 0.74
 0.29
 0.12
(4)
 X
 0.10
 0.14
 0.20
 0.30
 0.12
 0.09
 0.19
 0.53
 0.27
 0.11
 0.13
 0.22
 0.77
 0.34
 0.15
(5)
 X
 0.09
 0.11
 0.16
 0.24
 0.10
 0.07
 0.10
 0.13
 0.20
 0.09
 0.09
 0.16
 0.75
 0.23
 0.10
(6)
 X
 0.08
 0.11
 0.15
 0.22
 0.10
 0.06
 0.09
 0.12
 0.18
 0.08
 0.09
 0.16
 0.75
 0.22
 0.10
(7)
 X
 0.06
 0.09
 0.14
 0.18
 0.08
 0.07
 0.08
 0.11
 0.18
 0.08
 0.05
 0.12
 0.74
 0.15
 0.06

















(8)
 Y
 0.26
 0.48
 0.85
 1.08
 0.36
 0.26
 0.37
 0.53
 0.82
 0.32
 0.28
 0.49
 0.94
 1.04
 0.37
(9)
 Y
 0.25
 0.40
 1.77
 0.71
 0.30
 0.23
 0.37
 0.81
 0.61
 0.26
 0.29
 0.47
 1.11
 0.80
 0.34
(10)
 Y
 0.21
 0.45
 4.44
 0.55
 0.24
 0.19
 0.30
 0.44
 0.64
 0.25
 0.25
 0.38
 0.83
 0.65
 0.28
(11)
 Y
 0.19
 0.34
 1.67
 0.62
 0.24
 0.17
 0.30
 0.70
 0.44
 0.21
 0.24
 0.41
 1.07
 0.64
 0.27
(12)
 Y
 0.16
 0.27
 1.42
 0.43
 0.18
 0.17
 0.23
 0.33
 0.40
 0.19
 0.17
 0.30
 0.77
 0.52
 0.21
(13)
 Y
 0.15
 0.26
 1.42
 0.43
 0.18
 0.18
 0.21
 0.29
 0.40
 0.18
 0.17
 0.29
 0.76
 0.50
 0.20
(14)
 Y
 0.14
 0.25
 1.43
 0.39
 0.17
 0.12
 0.18
 0.28
 0.37
 0.15
 0.15
 0.28
 0.75
 0.50
 0.19

















(1/8)
 Eucl.e
 0.38
 0.58
 0.90
 1.13
 0.44
 0.37
 0.51
 0.69
 1.14
 0.43
 0.52
 0.79
 1.37
 1.64
 0.62
(2/9)
 Eucl.
 0.32
 0.48
 1.78
 0.76
 0.36
 0.30
 0.51
 0.97
 0.90
 0.34
 0.37
 0.57
 1.34
 0.89
 0.40
(3/10)
 Eucl.
 0.29
 0.52
 4.45
 0.64
 0.30
 0.25
 0.36
 0.47
 0.67
 0.30
 0.30
 0.46
 1.12
 0.69
 0.32
(4/11)
 Eucl.
 0.26
 0.40
 1.68
 0.67
 0.29
 0.24
 0.42
 0.88
 0.56
 0.27
 0.30
 0.51
 1.32
 0.80
 0.33
(5/12)
 Eucl.
 0.22
 0.32
 1.43
 0.48
 0.23
 0.21
 0.27
 0.36
 0.44
 0.23
 0.22
 0.37
 1.07
 0.57
 0.24
(6/13)
 Eucl.
 0.21
 0.31
 1.43
 0.46
 0.22
 0.20
 0.25
 0.31
 0.42
 0.21
 0.21
 0.36
 1.07
 0.53
 0.24
(7/14)
 Eucl.
 0.18
 0.28
 1.43
 0.44
 0.20
 0.16
 0.22
 0.30
 0.38
 0.18
 0.18
 0.34
 1.05
 0.53
 0.21

aSee Materials and Methods for descriptions of functions according to the number; bAll values in cm; cRoot Mean Square; d Maximum error of the 90th percentile of spots (dropping the 10th percentile of spots with the worst error). e Euclidean distance.

Smiraglia et al. BMC Genomics 2007 8:446   doi:10.1186/1471-2164-8-446