Table 5

ECM-related transcripts enriched in DEX-treated chondrocytes.

HUGO symbol

Rank

RMS

RES

HUGO symbol

Rank

RMS*

RES**


Dmp1

18

0.470

0.036

Matn4

882

0.081

0.420

Omd

27

0.409

0.068

Lama3

886

0.081

0.427

Itga5

38

0.358

0.095

Nyx

992

0.077

0.427

Adamts1

57

0.305

0.118

Lamb2

1082

0.073

0.429

Timp4

61

0.296

0.141

Bsg

1100

0.072

0.433

Col4a1

86

0.268

0.161

Fbn2

1242

0.068

0.432

Col4a2

98

0.247

0.180

Ntn4

1245

0.068

0.437

Adam12

112

0.225

0.197

5730577E14RIK

1381

0.064

0.435

Prelp

139

0.200

0.211

Col6a2

1405

0.064

0.439

Postn

142

0.195

0.227

Ntn3

1415

0.063

0.443

Chad

176

0.174

0.239

Tgfb2

1531

0.060

0.442

Mgp

195

0.168

0.251

Mia1

1575

0.059

0.445

Col1a1

232

0.154

0.261

Mmp14

1803

0.054

0.438

Mfap5

233

0.153

0.273

Col15a1

1845

0.053

0.440

Col10a1

266

0.146

0.283

Ctgf

1882

0.052

0.442

Smoc2

279

0.145

0.294

Col6a1

1942

0.052

0.443

Aspn

294

0.141

0.304

Gpld1

1946

0.051

0.447

Col4a5

367

0.128

0.310

Emid2

2043

0.050

0.446

Adamts15

385

0.126

0.319

Col7a1

2047

0.050

0.450

Tgfb1

394

0.125

0.329

Adam10

2107

0.049

0.451

Sparcl1

440

0.119

0.336

Col9a2

605

0.100

0.370

Adam17

483

0.112

0.343

Matn3

610

0.099

0.377

Lama5

508

0.110

0.350

Col11a2

636

0.097

0.384

Lamc1

517

0.109

0.358

Hapln1

650

0.096

0.391

Spock2

581

0.102

0.363

Lama2

685

0.092

0.396

Lama1

688

0.092

0.403

Gpc3

796

0.086

0.412

Ltbp4

704

0.091

0.410

Lama4

827

0.084

0.417


*RMS = the ranked metric score

**RES = the running enrichment score

James et al. BMC Genomics 2007 8:205   doi:10.1186/1471-2164-8-205

Open Data