Table 4

Metabolic transcripts enriched in DEX-treated chondrocytes. I.

HUGO symbol

Rank

RMS*

RES**

HUGO symbol

Rank

RMS*

RES**


Aldh1a1

26

0.417

0.053

Slc27a4

1616

0.058

0.426

Eya2

40

0.355

0.099

Ltbp2

1721

0.056

0.428

Vcl

106

0.228

0.125

Hsd17b1

1783

0.055

0.432

Adhfe1

116

0.222

0.154

P4ha2

1783

0.055

0.432

Ids

123

0.212

0.181

Mut

1850

0.053

0.443

Cbr3

133

0.204

0.207

Pde3a

2195

0.048

0.432

Aldh6a1

202

0.165

0.225

Sulf2

2200

0.048

0.438

Bcat2

224

0.157

0.245

Prep

2316

0.046

0.438

Pmm1

278

0.145

0.261

Plod3

2387

0.045

0.441

Pcx

553

0.105

0.261

1110013G13RIK

2510

0.043

0.440

Fthfd

554

0.105

0.275

Pld1

2669

0.041

0.437

Atp1a1

560

0.104

0.288

Au041707

2721

0.040

0.440

Gstm1

619

0.099

0.298

Decr1

2837

0.039

0.439

Gstm2

742

0.088

0.303

Gstm5

2872

0.038

0.443

1700061G19RIK

787

0.086

0.312

Bckdha

2932

0.038

0.445

Slc38a4

833

0.084

0.321

Atp11a

2951

0.038

0.449

Pyp

847

0.083

0.331

Gstp1

2967

0.037

0.453

Aacs

901

0.080

0.339

Dhrs7

3014

0.037

0.455

Plod1

934

0.079

0.348

Cbr2

3147

0.035

0.453

Acas2

983

0.077

0.355

Echdc3

3152

0.035

0.458

Auh

1068

0.074

0.361

Acy3

3254

0.035

0.457

Gcat

1109

0.072

0.368

Dhrs1

3483

0.032

0.450

Dhrs8

1184

0.070

0.373

Itgb1

3527

0.032

0.452

Egln3

1232

0.068

0.380

4933406E20RIK

3553

0.031

0.454

Mthfs

1268

0.067

0.387

Plod2

3574

0.031

0.458

Mvk

1298

0.066

0.394

Pmm2

3582

0.031

Aup1

1325

0.065

0.401

Ugp2

3583

0.031

Spr

1456

0.062

0.403

Gnpat

3633

0.031

Sc5dl

1462

0.062

0.411

1110003P22RIK

3636

0.031

1300018J18RIK

1516

0.061

0.416

Dbt

3710

0.030

Agpat3

1524

0.061

0.423


Rank = position of genes in the context of the ranked list of array genes

RMS = the ranked metric score

RES = the running enrichment score

James et al. BMC Genomics 2007 8:205   doi:10.1186/1471-2164-8-205

Open Data