Table 3

Specific genes expressed in the female sexual organs

Tissues from GEO and accession number


Tag

Testis

Prostate

Ovary

Mammary gland

Uterus

Vagina

Skin

Liver

Adipose tissue

Lung

Bone

Skeletal muscle

Cerebral cortex

Hypothalamus

Pituitary gland

Mouse embryonic fibroblasts GSM7759

Heart normal GSM106587

Thymus normal GSM106596

Bladder normal GSM106599

Kidney normal GSM56242

Spleen normal GSM106591

Pancreas Normal GSM106592

Intestine UniGene and EST expression (%)

Description [UniGene cluster, GenBank Accession No]

General function


Ovary

TGGCAGAAGCC

0a

0a

73

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

RIKEN cDNA 4930583H14 gene [Mm.273339, NM_026358]

Protein secretion

GTCAACACAGG

2a

0a

38

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

CATATGTTGAT

2a

0a

36

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

RIKEN cDNA 4921521F21 gene [Mm.18725, NM_027582]

catalyzes the reduction of 2,5-diketo-d-gluconic acid

Mammary gland

TCCGGAGAAAA

0a

1a

0a

35

0a

0a

1a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

CTAGGTGGTGC

0a

0a

0a

32

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

glycosylation dependent cell adhesion molecule 1 [Mm.219621, NM_008134]

Cell signaling

Uterus

TCTGACGATGT

0a

0a

0a

0a

130

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

73

proline-rich acidic protein 1 [Mm.141646, NM_009475]

Cell signaling

GAAGCTGTATG

0a

0a

2a

0a

33

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

2a

0a

0a

25

Hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2 [Mm.5079, BC014753]

Steroid hormone synthesis

TACATAGATGG

0a

1a

0a

0a

31

0a

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

85

chloride channel calcium activated 3 [Mm.33483, NM_017474]

Cell signaling

Vagina

CTGTATTTGGG

0a

0a

0a

0a

2a

114

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

AAGCACCAAAT

0a

0a

0a

0a

2a

85

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

AAAGCATCCTT

0a

0a

0a

0a

1a

77

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin intermediate filament 16a [Mm.343031, XM_484082]

Cell structure

CAGAACCTCAA

0a

0a

0a

0a

1a

39

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

26

keratin complex 1, acidic, gene 13 [Mm.4646, BY709670]

Cell structure

GCCTTGGAGGT

0a

0a

0a

0a

2a

35

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin complex 2, basic, gene 6 g [Mm.22657, NM_010669]

Cell structure

GGGACTCCTCC

0a

0a

0a

0a

0a

34

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

9a

84

retinol binding protein 2, cellular [Mm.12825, NM_009034]

Intracellular transport


a Significant difference vs. no. of tags show n in bold (p < 0,05)

Kouadjo et al. BMC Genomics 2007 8:127   doi:10.1186/1471-2164-8-127

Open Data