Table 2

Previously annotated protein coding genes predicted herein to be miRNA genes in tammar
miRNA count Ensembl Meug 1.0 annotation Symbol Hairpin alignment mRNA mirBase
1389 ENSMEUG00000014939 PANK3 ((((.(((((((((((.((.(((((((((((.(((......)))))))))))))).)))))).))))))).))))........(((((((......))))))). X age-mir-103
1145 ENSMEUG00000004480 NFYC ((((((.((..((((...)))).))))))))(((((((.((((((((((((((((.(((((((((((........)))))))))))))))))))))))))))))))))). X eca-mir-30e
554 ENSMEUG00000000911 CDC20B ......((((.(((…))).))))..((.(((((((((((((((((((((.((.(((((((........))))))))).)))).))))))))))))))))).)). X
349 ENSMEUG00000016575 HOXD4 .(((.(((((((....))).)))).))).(((((.((((((((.((((.(((((.((((((((((........)))))))))).))))))))).)))))))).))))). X aca-mir-10b
79 ENSMEUG00000012110 PFDN5 …((((((((((((...((((.((.......)).))))))))))((((((((.((...)).))))))))...)))))).....((((...)))).
26 ENSMEUG00000012937 BCAS3 ......((((.((((((((.......)))))))).))))(((((((.(((…((.((.(((…(((((((…)))))))..))).)).)).)))))))))).
26 ENSMEUG00000008344 MYOZ2 (((((((.((((.((.(((((((((((((.......((.((((…(((((((......))))))))))).))))))))))))))).)))))).)))…)))). X
26 ENSMEUG00000004683 GRIA1 ...(((...(((((.((((((((((.(((((((.((.......)).)))))))..))))))).(((.((((…)))))))...))))))))....))).. X

For each, the number of miRNA reads, identification of mRNA transcripts in embryos and any identified miRBase orthologs are indicated.

Lindsay et al.

Lindsay et al. BMC Genomics 2012 13:559   doi:10.1186/1471-2164-13-559

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