Table 1

Characteristics of non-TIR and TIR-NBS CaRGAs from pepper (Capsicum anuum L.)
Non-TIR/TIR Class Clone name

Length of encoding nucleotide

residues (bp) and amino acids (aa)

GenBank accession number
Non-TIR-NBS-LRR CaRGA I CaRGA23;CaRGA28;CaRGA34;CaRGA43; CaRGA25;CaRGA39;CaRGA32;CaRGA20; CaRGA21;CaRGA26;CaRGA31;CaRGA24; CaRGA19;CaRGA37;CaRGA48;CaRGA41; CaRGA45; CaRGA46; CaRGA38 723/240;722/240;722/240;706/234728/242;701/233;722/240;697/232 684/227;728/242;712/237;731/243 730/243;731/243;613/204;703/234 510/170; 608/202; 707/235 DQ205986;DQ205995; DQ206007; DQ206021; DQ205988;DQ206016; DQ206000; DQ205982; DQ205984;DQ205989; DQ205999; DQ205987; DQ205981;DQ206010; FJ605106; DQ206019; FJ605101; FJ605102; DQ206015
CaRGA II CaRGA18;CaRGA30;CaRGA47;CaRGA22; CaRGA27;CaRGA33;CaRGA35;CaRGA29; CaRGA36; CaRGA40; CaRGA42 704/234;706/234;628/209;725/241 709/236;692/230;714/238;655/218 725/241; 725/241;725/241 DQ205980; DQ205998; FJ605103; DQ205985; DQ205992; DQ206001;DQ206008; DQ205997; DQ206009; DQ206018; DQ206020
CaRGA III CaRGA51;CaRGA16;CaRGA13; CaRGA17 Bs2; CaMi 525/175;513/171;501/167; 501/167 2715/905; 3774/1257 AF513548; JN112315; JN112312; JN112316 AF202179; DQ465824
CaRGA IV CaRGA14; CaRGA15 516/172; 516/172 JN112313; JN112314
TIR-NBS-LRR CaRGA V CaRGA49; CaRGA50; CaRGA44 512/171;563/178; 492/161 FJ605108; FJ605109; FJ605100
CaRGA VI CaRGA03;CaRGA09;CaRGA05; CaRGA06 495/165;456/152; 495/165;495/165 JN112302; JN112308; JN112304; JN112305
CaRGA VII CaRGA04;CaRGA02;CaRGA10;CaRGA01; CaRGA07;CaRGA11;CaRGA08; CaRGA12 513/171;504/168;504/168;504/168 504/168;504/168;504/168;504/168 JN112303;JN112301;JN112309;JN112300; JN112306; JN112310; JN112307; JN112311

Wan et al.

Wan et al. BMC Genomics 2012 13:502   doi:10.1186/1471-2164-13-502

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