Open Access Research article

Transcriptomic analysis of the red seaweed Laurencia dendroidea (Florideophyceae, Rhodophyta) and its microbiome

Louisi Souza de Oliveira1, Gustavo Bueno Gregoracci1, Genivaldo Gueiros Zacarias Silva2, Leonardo Tavares Salgado3, Gilberto Amado Filho3, Marcio Alves-Ferreira4, Renato Crespo Pereira5 and Fabiano L Thompson1*

Author Affiliations

1 Departamento de Biologia Marinha, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) Av. Carlos Chagas Filho, 373-CCS - IB - BLOCO A (ANEXO) A3- 202, Rio de Janeiro, 21941-599, Brazil

2 Laboratório de Bioinformática e Biologia Evolutiva, Universidade Federal de Pernambuco. Av. Prof. Moraes Rego 1235, Cidade Universitária, Recife, 50670-901, PE, Brazil

3 Instituto de Pesquisa Jardim Botânico do Rio de Janeiro, Rua Pacheco Leão, 915. Jardim Botânico, Rio de Janeiro, 22460-030, RJ, Brazil

4 Departamento de Genética. Instituto de Biologia. Av. Prof. Rodolpho Paulo Rocco, s/n, CCS, Sala A2-93, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, 21941-599, RJ, Brazil

5 Departamento de Biologia Marinha, Universidade Federal Fluminense (UFF). Morro do Valonguinho, s/n. Centro, Niteroi, 24001-970, RJ, Brazil

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BMC Genomics 2012, 13:487  doi:10.1186/1471-2164-13-487

Published: 17 September 2012

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COG functional profile of the transcriptome of L. dendroidea (separate samples).

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Bacterial phyla recognized on the transcriptome of L. dendroidea (separate samples).

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Relevant functions for the interaction between Bacteria and Eukarya in the transcriptomic profile of the holobiont.

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