Open Access Research article

Transcriptomic analysis of the red seaweed Laurencia dendroidea (Florideophyceae, Rhodophyta) and its microbiome

Louisi S de Oliveira1, Gustavo B Gregoracci1, Genivaldo Gueiros Z Silva2, Leonardo T Salgado3, Gilberto A Filho3, Marcio Alves-Ferreira4, Renato C Pereira5 and Fabiano L Thompson1*

1 Departamento de Biologia Marinha, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) Av. Carlos Chagas Filho, 373-CCS - IB - BLOCO A (ANEXO) A3- 202, Rio de Janeiro, 21941-599, Brazil

2 Laboratório de Bioinformática e Biologia Evolutiva, Universidade Federal de Pernambuco. Av. Prof. Moraes Rego 1235, Cidade Universitária, Recife, 50670-901, PE, Brazil

3 Instituto de Pesquisa Jardim Botânico do Rio de Janeiro, Rua Pacheco Leão, 915. Jardim Botânico, Rio de Janeiro, 22460-030, RJ, Brazil

4 Departamento de Genética. Instituto de Biologia. Av. Prof. Rodolpho Paulo Rocco, s/n, CCS, Sala A2-93, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, 21941-599, RJ, Brazil

5 Departamento de Biologia Marinha, Universidade Federal Fluminense (UFF). Morro do Valonguinho, s/n. Centro, Niteroi, 24001-970, RJ, Brazil

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BMC Genomics 2012, 13:487 doi:10.1186/1471-2164-13-487

Published: 17 September 2012

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COG functional profile of the transcriptome of L. dendroidea (separate samples).

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Bacterial phyla recognized on the transcriptome of L. dendroidea (separate samples).

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Relevant functions for the interaction between Bacteria and Eukarya in the transcriptomic profile of the holobiont.

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