Table 2

Clade-specific genes
Included species/subspecies Excluded species/subspecies #unique genes Reference genome
F. tularensis subsp. tularensis All other 0 SCHUS4
F. tularensis subsp. holarctica All other 0 LVS
F. tularensis subsp. mediasiatica All other 0 FSC147
F. philomiragia All other 9 ATOC 25017
F. noatunensis subsp. noatunensis All other 32 FSC769
F. noatunensis subsp. orientalis All other 114 FSC770
F. novicida All other 0 U112
F. hispaniensis All other 7 FSC454
Wolbachia persica All other 125 FSC845
Fangia hongkongensis All other 1104 FSC776
Piscirickettsia salmonis All other 1725 FSC773
F. tularensis subsp. tularensis, F. tularensis subsp. holarctica, F. tularensis subsp. mediasiatica F. novicida, F. hispaniensis, W. persica F. noatunensis subsp. orientalis, F. noatunensis subsp. noatunensis, P salmonis 7 SCHUS4
F. noatunensis subsp. orientalis, F. noatunensis subsp. noatunensis, F. philomiragia F. tularensis subsp. tularensis, F. tularensis subsp. holarctica, F. tularensis subsp. mediasiatica, F. novicida, F. hispaniensis, W. persica, F. hongkongensis, P. salmonis 41 FSC769
F. noatunensis subsp. orientalis, F. noatunensis subsp. noatunensis F. philomiragia, F tularensis subsp. tularensis, F. tularensis subsp. holarctica, F. tularensis subsp. mediasiatica, F. novicida, F. hispaniensis, W. persica, F. hongkongensis, P. 10 FSC769
F. noatunensis subsp. noatunensis, F. philomiragia F. noatunensis subsp. orientalis, F. tularensis subsp. tularensis, F. tularensis subsp. holarctica, F. tularensis subsp. mediasiatica, F. novicida, F. hispaniensis, P. salmonis 9 FSC769

Summary of clade-specific genes in the Francisella genus.

Sjödin et al.

Sjödin et al. BMC Genomics 2012 13:268   doi:10.1186/1471-2164-13-268

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