Table 1

Coverage depth of Brassica contigs anchored onto Arabidopsis genome sequence.

Before removing ancient duplication

After removing ancient duplication

Coverage depth

Covered length (Kb)

Fraction

Covered length (Kb)

Fraction


B. oleracea

0

15742

0.132

17125

0.144

1

20164

0.169

22832

0.192

2

28996

0.244

31783

0.267

3

28731

0.241

28741

0.242

4

15972

0.134

12860

0.108

5

6275

0.053

3943

0.033

6

1916

0.016

940

0.008

7

683

0.006

400

0.003

8

150

0.001

20

0.000

9

34

0.000

27

0.000

10

130

0.001

130

0.001

11

167

0.001

168

0.001

12

12

0.000

7

0.000

> 13

28

0.000

24

0.000


B. rapa

0

8614

0.072

10857

0.091

1

13673

0.115

19177

0.161

2

18150

0.153

22888

0.192

3

22567

0.190

26523

0.223

4

21306

0.179

19988

0.168

5

16264

0.137

10861

0.091

6

9219

0.077

4029

0.034

7

4379

0.037

1723

0.014

8

1944

0.016

612

0.005

9

634

0.005

202

0.002

10

242

0.002

213

0.002

11

172

0.001

97

0.001

12

107

0.001

106

0.001

13

1729

0.015

1724

0.014


Wang et al. BMC Genomics 2011 12:470   doi:10.1186/1471-2164-12-470

Open Data