Table 1

Compositional comparison of Core Islands e1-e5 (with relative dissimilarities of 10%) of Escherichia coli O157H7 with each other (underlined), and Genomic Islands with each other (bold)

Genomic dissimilarity values (δ*)

Start coordinate

End coordinate

size (bp)

E. coli

    e1

    e2

    e3

    e4

    e5

GI8

GI24

GI25


E. coli

0

5498450

5498450

0

18,6

18,5

18,5

18,7

18,9

47,2

58,1

49,0

    e1

4770000

4785000

15001

18,6

    0

    22,3

    24,7

    29,2

    30,2

59,8

72,7

65,8

    e2

2445000

2460000

15001

18,5

    22,3

    0

    16,2

    22,5

    28,0

58,3

68,6

63,2

    e3

1695000

1710000

15001

18,5

    24,7

    16,2

    0

    12,2

    21,6

53,0

60,8

57,7

    e4

135000

150000

15001

18,7

    29,2

    22,5

    12,2

    0

    29,7

59,4

67,2

61,5

    e5

1455000

1470000

15001

18,9

    30,2

    28,0

    21,6

    29,7

    0

49,8

54,7

47,0

GI8

892240

903808

11568

47,2

59,8

58,3

53,0

59,4

49,8

0

24,4

24,9

GI24

2924490

2936721

12231

58,1

72,7

68,6

60,8

67,2

54,7

24,4

0

22,0

GI25

3193144

3204209

11065

49,0

65,8

63,2

57,7

61,5

47,0

24,9

22,0

0


Roos and van Passel BMC Genomics 2011 12:427   doi:10.1186/1471-2164-12-427

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