Table 4 |
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HLA alleles originally mistyped in the gold standard dataset |
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Population |
Occurrences |
454 type |
Original type |
Difference(s) |
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YRI |
11 |
C*02:10 |
C*02:02 |
31346962 T>C |
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CHB/JPT |
10 |
A*02:07 |
A*02:01 |
30019048 A>T |
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JPT |
2 |
C*08:03 |
C*08:01 |
31346853 C>T |
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CEU |
2 |
C*07:01 |
C*07:02 |
31347428 C>G |
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YRI |
2 |
A*66:03 |
A*66:02 |
30018721 G>C |
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YRI |
2 |
A*36:03 |
A*36:01 |
30019043 A>G |
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JPT |
2 |
A*26:02 |
A*26:01 |
30018098 G>A |
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CEU |
1 |
C*06:06 |
C*06:02 |
31346910 A>G |
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CEU |
1 |
C*05:01 |
C*16:01 |
31347486 A>T |
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31347396 A>T |
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31347522 A>T |
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CEU |
1 |
C*03:04 |
C*03:03 |
31347355 C>T |
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JPT |
1 |
C*01:03 |
C*01:02 |
31347029 T>A |
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31347036 A>T |
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YRI |
1 |
B*39:24 |
B*39:03 |
31432177 G>A |
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CEU |
1 |
B*39:06 |
B*39:05 |
31432180 G>C |
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31432185 C>G |
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31432186 C>A |
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31432187 C>G |
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31432188 C>G |
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|
31432495 C>A |
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JPT |
1 |
A*11:02 |
A*11:01 |
30018566 A>G |
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Erlich et al. BMC Genomics 2011 12:42 doi:10.1186/1471-2164-12-42 |
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