Table 3

SSR frequencies of repeat type with repeat numbers in A. tridentata ssp. tridentata (A.t.t.) and ssp. vaseyana (A.t.v.).

Motif

Repeat number

Total


A.t.t.

A.t.v.

A.t.t.

A.t.v.

A.t.t.

A.t.v.

A.t.t.

A.t.v.

A.t.t.

A.t.v.

A.t.t.

A.t.v.

A.t.t.

A.t.v.

5

6

7

8

9

10


Di

-

-

-

-

104

15

34

2

17

1

31

9

186

27

Tri

431

250

186

127

75

35

30

16

10

10

17

8

749

446

Tetra

23

10

5

2

3

0

1

0

1

0

0

0

33

12

Penta

2

0

2

1

0

1

0

0

1

0

0

0

5

2

Hexa

22

16

3

0

2

3

1

1

1

0

1

0

30

20

Hepta

0

0

0

0

0

0

0

0

0

0

0

0

0

0


Total

478

276

196

130

184

51

66

19

30

11

49

17

1003

507

%

47.6

54.5

19.5

25.6

18.3

10.1

6.6

3.7

3.0

2.2

4.9

3.8


Bajgain et al. BMC Genomics 2011 12:370   doi:10.1186/1471-2164-12-370

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