Table 4

Adjacent linkage disequilibrium (r2 and |D'|) on 29 autosomes (BTA)

Chromosome

N

Length (Mb)

Spacing (kb)

Mean r2

SD (r2)

Median r2

Mean |D'|

SD |D'|

Median |D'|

MAF


1

2,443

158

64

0.22

0.25

0.11

0.73

0.32

0.90

0.28

2

1,970

136

69

0.22

0.25

0.11

0.70

0.33

0.85

0.29

3

1,859

121

65

0.22

0.25

0.12

0.73

0.33

0.90

0.29

4

1,804

120

66

0.20

0.23

0.10

0.70

0.34

0.86

0.29

5

1,603

121

75

0.20

0.24

0.10

0.71

0.33

0.87

0.29

6

1,848

119

64

0.21

0.25

0.11

0.70

0.33

0.85

0.29

7

1,615

112

69

0.23

0.25

0.13

0.71

0.32

0.86

0.29

8

1,721

113

65

0.21

0.25

0.11

0.73

0.32

0.89

0.28

9

1,487

105

70

0.20

0.23

0.10

0.70

0.33

0.85

0.28

10

1,559

104

66

0.21

0.24

0.12

0.71

0.32

0.84

0.29

11

1,654

107

64

0.20

0.23

0.10

0.70

0.33

0.85

0.29

12

1,260

91

72

0.20

0.24

0.10

0.70

0.33

0.84

0.28

13

1,319

84

63

0.21

0.24

0.12

0.72

0.33

0.90

0.30

14

1,326

84

62

0.23

0.26

0.13

0.72

0.32

0.88

0.30

15

1,267

85

66

0.19

0.23

0.09

0.70

0.33

0.87

0.29

16

1,166

81

69

0.22

0.25

0.12

0.72

0.32

0.88

0.29

17

1,194

74

62

0.19

0.23

0.10

0.72

0.32

0.87

0.29

18

1,013

65

64

0.18

0.22

0.09

0.66

0.34

0.78

0.30

19

1,039

64

61

0.19

0.23

0.10

0.70

0.33

0.85

0.29

20

1,126

71

63

0.21

0.23

0.12

0.72

0.31

0.85

0.29

21

1,031

71

69

0.20

0.24

0.10

0.68

0.33

0.81

0.30

22

965

61

63

0.19

0.25

0.09

0.69

0.33

0.82

0.28

23

818

52

63

0.18

0.22

0.09

0.64

0.35

0.74

0.30

24

922

62

67

0.20

0.24

0.10

0.68

0.33

0.82

0.29

25

770

42

55

0.20

0.23

0.11

0.68

0.33

0.79

0.30

26

804

51

63

0.18

0.24

0.08

0.67

0.34

0.82

0.28

27

745

45

60

0.17

0.22

0.07

0.66

0.34

0.77

0.29

28

731

46

63

0.17

0.20

0.09

0.65

0.34

0.73

0.30

29

811

51

63

0.17

0.22

0.09

0.68

0.33

0.79

0.29

X

690

148

215

0.18

0.23

0.08

0.59

0.33

0.63

0.29

All

38,560

2656

68

0.20

0.24

0.11

0.70

0.33

0.85

0.29


Bohmanova et al. BMC Genomics 2010 11:421   doi:10.1186/1471-2164-11-421

Open Data