Table 2

The Pearson's correlations and standard deviations for intra-method and inter-method comparisons for 739 high intensity genes.

Unamp A

Unamp A

Unamp B

0.78

Unam p B

Unamp C

0.78

0.90

Unamp C

Mod T7 D

0.72

0.79

0.78

Mod T7 D*

Mod T7 E

0.72

0.80

0.77

0.89

Mod T7 E

Mod T7 F

0.73

0.77

0.76

0.90

0.87

Mod T7 F

Mod T7 G

0.73

0.77

0.76

0.90

0.86

0.94

Mod T7 G

Mod T7 H

0.74

0.81

0.79

0.91

0.87

0.94

0.96

Mod T7 H

Mod T7 I

0.78

0.80

0.79

0.90

0.86

0.94

0.95

0.95

Mod T7 I

Arcturus J

0.71

0.78

0.77

0.89

0.87

0.89

0.91

0.92

0.90

Arcturus J

Arcturus K

0.72

0.80

0.77

0.88

0.87

0.86

0.86

0.88

0.86

0.89

Arcturus K

Arcturus L

0.73

0.79

0.79

0.88

0.85

0.86

0.88

0.89

0.88

0.88

0.86

Arcturus L

Arcturus M

0.74

0.82

0.80

0.92

0.88

0.88

0.90

0.92

0.89

0.90

0.91

0.93

Arcturus M

Bal PCR N

0.72

0.78

0.77

0.85

0.82

0.82

0.83

0.84

0.84

0.82

0.81

0.84

0.86

Bal PCR N

Bal PCR O

0.71

0.77

0.75

0.85

0.82

0.80

0.80

0.82

0.82

0.80

0.81

0.82

0.85

0.93

Bal PCR O

Bal PCR P

0.66

0.74

0.72

0.83

0.79

0.77

0.78

0.79

0.79

0.76

0.78

0.79

0.83

0.87

0.86

Bal PCR P

Bal PCR Q

0.68

0.73

0.72

0.81

0.78

0.76

0.77

0.78

0.78

0.76

0.77

0.80

0.82

0.89

0.90

0.85

Bal PCR Q

Intramethod

Intermethod Mean R2

Mean R2

SD

Range

Unamp

SD

Mod T7

SD

Arcturus

SD

Bal PCR

SD


Unamp

0.82

0.06

0.78–0.90

0.77

0.03

0.77

0.03

0.73

0.03

Mod T7

0.91

0.03

0.86–0.96

0.77

0.03

0.88

0.02

0.81

0.03

Arcturus

0.90

0.02

0.86–0.93

0.77

0.03

0.88

0.02

0.81

0.03

Bal PCR

0.88

0.03

0.82–0.93

0.73

0.03

0.81

0.03

0.81

0.03


Lang et al. BMC Genomics 2009 10:326   doi:10.1186/1471-2164-10-326

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