Table 1

Transmission disequilibrium of 13 VDR-SNPs in affected and unaffected children. P-values < 0.05 are indicated in bold.

asthma

no asthma


LD block *

dbSNP

allele

chr12 (bp)

geno-types

freq (%)

T

UT

T/UT

P

T

UT

T/UT

P

P TDTDS


A

hCV2880804

C

47954855

918

28

170

178

1,0

0,668

18

33

0,5

0,049

0,055

--

rs2228570

T

47977944

724

35

159

150

1,1

0,609

21

12

1,8

0,117

0,079

?

rs3819545

C

47981753

912

38

186

191

1,0

0,797

25

31

0,8

0,423

1,000

B

rs3782905

G

47982914

934

32

201

174

1,2

0,163

26

27

1,0

0,891

0,388

?

rs2853563

G

48248398

661

97

20

24

0,8

0,547

--

--

--

--

--

B

rs731236

C

48251417

923

37

202

206

1,0

0,843

25

29

0,9

0,586

0,767

B

rs1544410

A

48252495

896

37

190

186

1,0

0,837

23

26

0,9

0,668

1,000

B?

rs2239185

C

48257219

903

49

198

214

0,9

0,431

29

24

1,2

0,492

0,650

?

rs987849

C

48267336

825

45

164

169

1,0

0,784

28

18

1,6

0,140

0,173

B

rs1540339

A

48269986

916

36

189

187

1,0

0,575

25

27

0,9

0,782

0,706

?

rs2239186

C

48282070

929

19

116

145

0,8

0,073

20

18

1,1

0,746

0,189

C

rs1989969

T

48290670

922

43

204

198

1,0

0,765

39

20

2,0

0,013

0,025

C

rs2853564

C

48291147

920

44

196

201

1,0

0,802

38

20

1,9

0,018

0,021


*according to reference [15]

Wjst BMC Genetics 2005 6:2   doi:10.1186/1471-2156-6-2

Open Data