Table 7
The mean, minimum and maximum of power estimates*of the test statistics for digenic, trigenic and quadrigenic disequilibria obtained for nine combinations of minor allele frequency (MAF) categories at each of the two loci (MAFAand MAFB) for all syntenic (intra-chromosome) SNP pairs over 29 chromosomes and for all non-syntenic (inter-chromosome) SNP pairs over 406 [29(29-1)/2] chromosome pairs in the Kinsella composite beef population
MAFA	MAFB		Intra-chromosome					Inter-chromosome
	< 0.1	Mean	0.389	0.031	0.032	0.018	0.290	0.282	0.014	0.014	0.022	0.212
< 0.1		Min	0.342	0.016	0.008	0.013	0.251	0.243	0.002	0.004	0.017	0.183
		Max	0.444	0.049	0.084	0.024	0.328	0.317	0.037	0.052	0.027	0.241
	0.1-0.3	Mean	0.464	0.000	0.056	0.029	0.308	0.323	0.000	0.035	0.029	0.202
		Min	0.396	0.000	0.034	0.024	0.261	0.286	0.000	0.022	0.026	0.180
		Max	0.544	0.002	0.104	0.036	0.364	0.361	0.000	0.058	0.034	0.225
	0.3-0.5	Mean	0.477	0.000	0.187	0.051	0.136	0.323	0.000	0.183	0.041	0.094
		Min	0.420	0.000	0.157	0.039	0.120	0.286	0.000	0.154	0.034	0.086
		Max	0.565	0.000	0.216	0.072	0.160	0.361	0.000	0.219	0.049	0.104
	< 0.1	Mean	0.463	0.053	0.000	0.030	0.310	0.320	0.034	0.000	0.030	0.204
0.1-0.3		Min	0.403	0.042	0.000	0.025	0.271	0.283	0.022	0.000	0.025	0.181
		Max	0.514	0.077	0.001	0.035	0.356	0.354	0.057	0.000	0.034	0.232
	0.1-0.3	Mean	0.501	0.004	0.004	0.071	0.275	0.357	0.002	0.002	0.056	0.171
		Min	0.448	0.003	0.003	0.065	0.236	0.336	0.001	0.001	0.053	0.161
		Max	0.544	0.006	0.008	0.085	0.318	0.377	0.003	0.003	0.059	0.188
	0.3-0.5	Mean	0.505	0.003	0.201	0.090	0.127	0.363	0.002	0.194	0.062	0.086
		Min	0.464	0.002	0.182	0.082	0.117	0.340	0.002	0.168	0.060	0.081
		Max	0.552	0.004	0.221	0.108	0.139	0.389	0.003	0.222	0.065	0.091
	< 0.1	Mean	0.476	0.188	0.000	0.051	0.137	0.326	0.182	0.000	0.042	0.095
0.3-0.5		Min	0.424	0.158	0.000	0.042	0.125	0.288	0.152	0.000	0.034	0.083
		Max	0.537	0.209	0.000	0.062	0.150	0.365	0.215	0.000	0.049	0.105
	0.1-0.3	Mean	0.506	0.201	0.003	0.090	0.128	0.365	0.194	0.002	0.062	0.086
		Min	0.460	0.170	0.002	0.080	0.116	0.347	0.170	0.002	0.059	0.081
		Max	0.548	0.223	0.005	0.101	0.140	0.388	0.221	0.004	0.065	0.092
	0.3-0.5	Mean	0.512	0.200	0.199	0.095	0.101	0.373	0.193	0.193	0.063	0.067
		Min	0.479	0.158	0.178	0.083	0.089	0.350	0.167	0.167	0.061	0.065
		Max	0.559	0.226	0.220	0.107	0.113	0.397	0.220	0.221	0.066	0.071

* Proportion of marker pairs that X² exceeded 3.84, the 5% critical value of .

Jiang et al. BMC Genetics 2012 13:65   doi:10.1186/1471-2156-13-65