Table 2

Distribution of 14 main haplotype frequencies in the MUC4 gene in corresponding pig populations
N Hap1 Hap2 Hap3 Hap4 Hap5 Hap6 Hap7 Hap8 Hap9 Hap10 Hap11 Hap12 Hap13 Hap14
ALL 278 0.183 0.155 0.115 0.090 0.065 0.043 0.032 0.032 0.029 0.025 0.025 0.025 0.022 0.022
Chinese breeds 182 0.290 0.028 0.017 0.142 0.102 0.000 0.051 0.051 0.011 0.040 0.040 0.040 0.034 0.000
  Bama Xiang 12 0.000 0.167 0.083 0.000 0.083 0.000 0.083 0.000 0.000 0.000 0.417 0.000 0.000 0.000
  Erhualian 46 0.435 0.000 0.000 0.283 0.065 0.000 0.000 0.000 0.000 0.043 0.000 0.065 0.000 0.000
  Hang 18 0.167 0.000 0.000 0.167 0.000 0.000 0.333 0.333 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
  Jiangquhai 22 0.364 0.000 0.000 0.182 0.000 0.000 0.000 0.000 0.091 0.091 0.000 0.045 0.000 0.000
  Jinhua 14 0.071 0.000 0.000 0.000 0.286 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.429 0.000
  Laiwu 10 0.000 0.200 0.200 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.000
  Rongchang 4 0.000 0.000 0.000 0.000 0.250 0.000 0.000 0.250 0.000 0.000 0.250 0.000 0.000 0.000
  Shaziling 6 0.000 0.000 0.000 0.000 0.167 0.000 0.000 0.167 0.000 0.000 0.167 0.167 0.000 0.000
  Tibet 8 0.375 0.000 0.000 0.000 0.125 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.125 0.000 0.000
  Tongcheng 10 0.400 0.100 0.000 0.100 0.100 0.000 0.200 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
  Yushan Black 26 0.462 0.000 0.000 0.154 0.231 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.038 0.000 0.000
Western breeds 102 0.000 0.373 0.284 0.000 0.000 0.118 0.000 0.000 0.059 0.000 0.000 0.000 0.000 0.059
  Duroc 14 0.000 0.071 0.071 0.000 0.000 0.071 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.357
  Landrace 38 0.000 0.474 0.289 0.000 0.000 0.211 0.000 0.000 0.026 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
  Large White 50 0.000 0.380 0.340 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020

N, Number of haplotypes, the 14 haplotypes were ordered by their frequencies in all tested animals. Red (blue) background represents the haplotypes that are unique to Chinese (Western) breeds.

Yang et al.

Yang et al. BMC Genetics 2012 13:57   doi:10.1186/1471-2156-13-57

Open Data