<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML">
<mml:mrow> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>s</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mo>,</mml:mo>
<mml:mi>j</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mo>min</mml:mo>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mfenced close="" open="{" separators=""> <mml:mrow> <mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mtable> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>s</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mo>&#8722;</mml:mo>
<mml:mn>1</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
<mml:mi>j</mml:mi>
<mml:mo>&#8722;</mml:mo>
<mml:mn>1</mml:mn>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo>+</mml:mo>
<mml:mfenced close="" open="{" separators=""> <mml:mrow> <mml:mtable> <mml:mtr> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mn>0</mml:mn>
</mml:mtd>
<mml:mtd> <mml:mspace width="1.5em"/>
<mml:mtext>if</mml:mtext>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>r</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>g</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>j</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi mathvariant="script">S</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="1em"/>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mspace width="1.9em"/>
<mml:mtext>if</mml:mtext>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>r</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mo>&#8800;</mml:mo>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>g</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>j</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo>,</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>&#348;</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>g</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>j</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mtext>MISMATCHPRIOR</mml:mtext>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mspace width="2em"/>
<mml:mtext>otherwise</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mfenced>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>s</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mo>&#8722;</mml:mo>
<mml:mn>1</mml:mn>
<mml:mo>,</mml:mo>
<mml:mi>j</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo>+</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi mathvariant="script">I</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>s</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mo>,</mml:mo>
<mml:mi>j</mml:mi>
<mml:mo>&#8722;</mml:mo>
<mml:mn>1</mml:mn>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo>+</mml:mo>
<mml:mfenced close="" open="{" separators=""> <mml:mrow> <mml:mtable> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi mathvariant="script">D</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
</mml:mtd>
<mml:mtd> <mml:mspace width="1em"/>
<mml:mtext>if</mml:mtext>
<mml:mspace width="1em"/>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mover accent="true"> <mml:mrow> <mml:mi mathvariant="script">D</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mo>&#770;</mml:mo>
</mml:mover>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi>g</mml:mi>
</mml:mrow>
<mml:mrow> <mml:mi>j</mml:mi>
<mml:mo>&#8722;</mml:mo>
<mml:mn>1</mml:mn>
</mml:mrow>
</mml:msub>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mtext>DELETIONPRIOR</mml:mtext>
</mml:mtd>
<mml:mtd> <mml:mspace width="1em"/>
<mml:mtext>otherwise.</mml:mtext>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="2em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
<mml:mspace width="0.3em"/>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mfenced>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mfenced>
</mml:mrow>
</mml:math>