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Genome Biology 植物基因组学特刊

BioMed Central旗舰期刊Genome Biology本月将出版植物基因组学特刊,该特刊由来自英国基因组分析中心的Mario Caccamo和来自美国俄亥俄州立大学哥伦布分校的Grotewold担任客座编辑。特刊包含一系列非常有趣的基础研究和方法文章,并同时收有植物基因组学领域顶尖专家的专题综述和观点文章。我们精选出以下文章供您精读,同时您也可以点击这里浏览该特刊的全部内容。

研究型文章

Transcriptional and epigenetic variation in maize

由北京大学邓兴旺教授带领的团队详细分析了两种玉米自交系和正反杂交的根冠转录组和表观基因,研究结果表明杂交玉米的基因表达并无明显的父代偏向性,同时基因表达和组蛋白修饰在父代子代中呈正相关性。

Genotyping the USA national maize inbred seed bank

文章阐述一项非常重要的基因数据分析:通过基因分型的测序方法对681257SNP进行标记,进而分析了USDA-ARS种质库中的2815个玉米种质。

Cacao genome sequence

文章发现可可树基因组序列使得识别荚色调节基因成为了可能,并将有助于提升巧克力的品质。

Responses of the grapevine berry transcriptome to the environment

文章通过一项针对不同年代、不同环境下葡萄浆果的转录组和代谢组学的研究表明,其成熟初期最容易受到季节性变化影响

Structural variation in barley

一项针对14种大麦基因拷贝数变异的全基因组分析表明,与种植大麦相比,野生大麦的基因拷贝数变异相对较高。文章指出,DNA修复和模板滑动可能是形成拷贝数变异的原因。

Gene activity in Arabidopsis root hairs

文章通过拟南芥根毛细胞转录组学和蛋白质组学的参考图谱进行分析,指出mRNA丰度并不总是与蛋白质水平相关。

Wheat linkage map

小麦染色体1BL的物理地图提供了一个高品质的参考序列,并让我们更深入地了解小麦基因组的进化过程。

方法文章

Mapping method

文章给出一个新的映射测序方法,该方法结合了全基因组测序和遗传制图,能够提高拟南芥突变体的识别度,并同时适用于如水稻和大麦等作物物种。

评论综述

Crop breeding

该评论文章阐述下一代测序技术和生物信息学分析是如何加速作物育种发展的。

Plants-pollinator interactions

该评论文章阐述下一代测序技术和生物信息学分析是如何加速作物育种发展的。


继成功举办前两届会议后,Beyond the Genome 2013大会将于2013101日至3日在旧金山Mission Bay Conference Center会议中心召开。会议论坛将对基因组学领域的最新进展,包括植物基因组学、单细胞技术与信息学等进行深入讨论。欲了解更多信息,请点击这里

With best wishes

Gemma Bilsborough, D.Phil
Special Issue Editor

Clare Garvey, PhD
Editor, Genome Biology

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