Table 2 |
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Top paths of INH resistance in active sub-networks |
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Top paths in active sub-networks |
Savg(P) |
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Antibiotic efflux pumps |
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kasB--fabD--kasA--efpA--fbpC2--fbpB--ccsA |
1.277 |
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kasB--kasA--fadE24--efpA--fbpC2--fbpB--ccsA |
1.327 |
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kasB--kasA--efpA--fadE24--echA18'--fbpB--ccsA |
1.348 |
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Antibiotic degrading enzymes |
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fabG1--kasB--acpM--kasA--sigC--blaC |
1.247 |
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fabD--kasB--kasA--sigC--blaC |
1.299 |
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accD4--accD6--kasB--kasA--sigC--blaC |
1.331 |
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fabG1--acpM--accA3--fabD--kasA--sigC--blaC |
1.345 |
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SOS response |
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kasB--kasA--accD6--fadE23--fadE24--echA18'--dnaE2 |
1.255 |
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accA3--fabD--kasB--kasA--acpM--ruvA--ahpC |
1.262 |
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kasB--acpM--accD6--fadE23--fadE24--echA18'--dnaE2 |
1.284 |
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inhA--kasB--fabD--kasA--acpM--ruvA--ahpC |
1.304 |
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inhA--kasA--kasB--accD6--fadE23--echA18'--dnaE2 |
1.333 |
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fabD--kasB--accD6--fadA2--fadE24--echA18'--dnaE2 |
1.337 |
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Cytochromes |
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inhA--kasB--kasA--acpM--gpdA1--fbpB--ccsA |
0.961 |
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kasA--kasB--accD6--fadE23--fadD11--fbpB--ccsA |
0.964 |
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kasA--kasB--accD6--fadE23--echA7--fbpB--ccsA |
0.975 |
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kasA--kasB--accD6--fadE23--echA5--fbpB--ccsA |
0.998 |
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kas--acpM--kasB--fabD--atpD--ctaD--aceE |
1.214 |
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kasB--acpM--kasA--fabD--ctaD--aceE |
1.247 |
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kasA--kasB--acpM--accA3--fabD--ctaD--aceE |
1.248 |
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Chen et al. BMC Systems Biology 2012 6:5 doi:10.1186/1752-0509-6-5 |
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