Table 9

GO-based annotation of residual MCODE modules

n

n.ex

ex.mean

cor.mean

mf.mean

bp.mean

cc.mean


Int-1

14

13

7.37

0.1

0.49

0.44

0.5

Int-2

9

7

7.83

-0.02

0.27

0.24

0.52

Int-3

13

9

8.66

0.33

0.47

0.41

0.66

Int-4

13

12

8.29

0.06

0.4

0.44

0.58

Int-6

75

68

8.46

0.2

0.24

0.18

0.4

Int-7

58

43

8.3

0.19

0.26

0.16

0.38

Int-8

47

39

9.1

0.23

0.25

0.17

0.44

Int-9

74

70

9.44

0.28

0.27

0.24

0.43

Int-10

10

6

10.28

0.77

0.65

0.43

0.77

Int-11

29

27

9.12

0.4

0.36

0.33

0.63

Int-12

32

28

8.72

0.35

0.31

0.41

0.61

Int-13

79

46

9.99

0.49

0.36

0.31

0.48

Int-14

29

12

9.77

0.23

0.37

0.44

0.43


Lit-1

5

5

7.87

0.02

0.53

0.06

0.46

Lit-2

7

7

8.47

-0.01

0.44

0.32

0.74

Lit-3

145

139

8.42

0.06

0.25

0.15

0.35

Lit-5

5

2

8.69

0.16

0.3

0.16

0.61

Lit-6

144

140

8.69

0.1

0.26

0.19

0.41

Lit-7

21

21

7.98

0.05

0.33

0.19

0.39

Lit-8

98

96

8.72

0.16

0.24

0.24

0.41

Lit-9

15

15

8.67

0.15

0.26

0.2

0.45

Lit-10

128

122

8.62

0.21

0.28

0.16

0.42

Lit-12

40

39

8.79

0.23

0.29

0.28

0.51


Ortho-1

6

3

11.12

0.67

0.32

0.37

0.39

Ortho-3

12

8

8.65

0.32

0.45

0.37

0.66

Ortho-6

13

6

8.38

0.24

0.28

0.2

0.53

Ortho-7

10

10

9.16

0.12

0.44

0.21

0.68

Ortho-8

23

20

10.08

0.51

0.35

0.33

0.56

Ortho-9

10

6

10.28

0.77

0.65

0.43

0.77

Ortho-11

44

31

10.58

0.53

0.35

0.43

0.48

Ortho-12

35

15

8.81

0.45

0.44

0.28

0.64

Ortho-13

35

15

8.81

0.45

0.44

0.28

0.64

Ortho-14

29

12

9.77

0.23

0.37

0.44

0.43


HTP-1

67

56

8.74

0.12

0.3

0.16

0.41

HTP-2

17

15

9.23

0.17

0.45

0.16

0.44

HTP-3

20

18

9.06

0.08

0.45

0.28

0.5

HTP-4

17

15

8.83

0.14

0.38

0.16

0.37


GO-based annotation results for MCODE modules. Values in bold font are above the 0.5 threshold. The listed groups have not passed at least the two required GO thresholds, and thus received a low score.

Marras et al. BMC Systems Biology 2010 4:102   doi:10.1186/1752-0509-4-102

Open Data