www.biomedcentral.com

<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML">
<mml:semantics> <mml:mrow> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mi>S</mml:mi>
<mml:mi>e</mml:mi>
<mml:mi>t</mml:mi>
<mml:mi>s</mml:mi>
<mml:mo>:</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mi>V</mml:mi>
<mml:mi>a</mml:mi>
<mml:mi>r</mml:mi>
<mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mi>a</mml:mi>
<mml:mi>b</mml:mi>
<mml:mi>l</mml:mi>
<mml:mi>e</mml:mi>
<mml:mi>s</mml:mi>
<mml:mo>:</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mi>I</mml:mi>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mo>}</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mtext>set of promoters</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mi>J</mml:mi>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mi>j</mml:mi>
<mml:mo>}</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mtext>set of transcripts</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mi>K</mml:mi>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mi>k</mml:mi>
<mml:mo>}</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mtext>set of inducers</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:mi>T</mml:mi>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mtext>t</mml:mtext>
<mml:mo>}</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mtext>time</mml:mtext>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mi>P</mml:mi>
<mml:mi>j</mml:mi>
</mml:msub>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:mi>t</mml:mi>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mtext>protein level of transcript </mml:mtext>
<mml:mi>j</mml:mi>
<mml:mtext> at time </mml:mtext>
<mml:mi>t</mml:mi>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr> <mml:mtd> <mml:msub> <mml:mi>Y</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mi>j</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>1</mml:mn>
<mml:mtext> if transcript </mml:mtext>
<mml:mi>j</mml:mi>
<mml:mtext> is expressed from promoter </mml:mtext>
<mml:mi>i</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mn>0</mml:mn>
<mml:mtext> otherwise</mml:mtext>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:semantics>
</mml:math>