Table 2

Genotype and allele frequencies of the TPH1 gene polymorphisms.

Marker

Groupa

Genotypeb (frequency)

Allele (frequency)



(Total Number)

11

12

22

X2

p value

1

2

X2

p value


T-1721G

N(94)

54(.57)

37(.39)

3(.03)

2.79

0.248

145(.77)

43(.23)

0.36

0.548

P(92)

53(.58)

31(.34)

8(.09)

137(.75)

47(.26)

A-1067G

N(90)

53(.59)

34(.38)

3(.03)

1.62

0.446

140(.78)

40(.22)

0.74

0.389

P(92)

51(.55)

34(.37)

7(.08)

136(.74)

48(.26)

G-347T

N(102)

58(.57)

43(.42)

1(.01)

0.048

0.976

159(.78)

45(.22)

0.037

0.847

P(94)

52(.55)

41(.44)

1(.01)

145(.77)

43(.23)

T3804A

N(101)

56(.55)

38(.38)

7(.07)

2.17

0.304

152(.74)

52(.26)

0.015

0.946

P(96)

49(.51)

44(.46)

3(.03)

142(.74)

50(.26)

G7465A

N(100)

31(.31)

43(.43)

26(.26)

0.46

0.793

105(.53)

95(.48)

0.439

0.508

P(74)

25(.34)

33(.45)

16(.22)

83(.56)

65(.44)

A12517C

N(101)

58(.57)

39(.39)

4(.04)

0.232

0.890

155(.77)

47(.23)

0.207

0.649

P(96)

58(.60)

35(.37)

3(.03)

151(.79)

41(.21)

C18626G

N(100)

28(.28)

47(.47)

25(.25)

1.24

0.538

103(.52)

97(.49)

0.392

0.531

P(71)

25(.35)

28(.39)

18(.25)

78(.55)

64(.45)

A20004C

N(102)

40(.39)

45(.44)

17(.17)

1.726

0.422

125(.61)

79(.39)

1.795

0.18

P(89)

29(.32)

39(.44)

21(.24)

97(.54)

81(.46)

C27224T

N(95)

31(.33)

49(.52)

15(.16)

3.58

0.167

111(.58)

79(.42)

2.13

0.144

P(80)

23(.29)

35(.44)

22(.28)

81(.51)

79(.49)

A27237G

N(95)

49(.52)

40(.42)

6(.06)

0.57

0.751

138(.73)

52(.27)

0.677

0.411

P(78)

37(.47)

34(.44)

7(.09)

107(.69)

49(.34)


a. N indicates the matched normal controls, P indicates the bipolar patients.

b. 1 represents the major allele and 2 the minor allele.

Lai et al. BMC Medical Genetics 2005 6:14   doi:10.1186/1471-2350-6-14

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