Table 2

Molecular characterisation of paediatric S. pneumoniae serotypes by MLST


Allelic profile
Serotype
 ST
 aroE
 gdh
 gki
 recP
 spi
 xpt
 ddl
Serotype 1
 618
 13
 8
 4
 1
 7
 19
 14

3336
 13
 8
 4
 1
 7
 19
 161
Serotype 2
 3314
 2
 13
 4
 1
 6
 6
 6
Serotype 4
 1469
 8
 88
 103
 18
 46
 142
 161

3304
 1
 5
 1
 1
 15
 1
 14
Serotype 5
 289
 16
 12
 9
 1
 41
 33
 33

3338
 16
 12
 9
 1
 4
 33
 9

3404
 16
 12
 9
 1
 176
 33
 33

3313
 2
 12
 9
 10
 17
 1
 33

3339
 16
 12
 9
 1
 41
 33
 9
Serotype 6A
 912
 6
 57
 34
 28
 7
 1
 9

913
 6
 57
 83
 28
 7
 19
 9

1737
 6
 57
 34
 28
 6
 1
 9

2157
 1
 8
 1
 5
 42
 60
 14

3324
 7
 8
 1
 5
 42
 60
 14
Serotype 6B
 385
 7
 6
 1
 2
 6
 1
 14

3342
 60
 82
 4
 5
 42
 122
 28

3323
 7
 6
 1
 35
 6
 1
 14
Serotype 8
 3325
 7
 9
 15
 11
 93
 58
 70

3406
 7
 9
 15
 11
 178
 58
 70
Serotype 9L
 1735
 6
 5
 2
 5
 36
 1
 5

3305
 1
 8
 4
 15
 16
 3
 31

3317
 6
 5
 2
 6
 36
 1
 5
Serotype 9V
 2179
 15
 17
 4
 4
 6
 1
 17

3337
 15
 17
 4
 16
 6
 20
 161

3409
 15
 17
 4
 4
 179
 20
 17
Serotype 12F
 989
 12
 5
 89
 8
 6
 112
 14
Serotype 12B
 3335
 12
 5
 89
 8
 6
 25
 14
Serotype 14
 63
 2
 5
 36
 12
 17
 21
 14

3320
 6
 60
 1
 5
 27
 20
 6

3312
 2
 5
 89
 12
 27
 21
 14

3321
 6
 60
 4
 5
 27
 20
 6

3333
 10
 60
 4
 12
 15
 112
 6

3310
 2
 5
 36
 12
 27
 21
 14

3318
 6
 9
 4
 5
 27
 20
 6

3322
 6
 60
 4
 5
 27
 38
 6

3309
 2
 5
 36
 12
 17
 38
 14

3311
 2
 5
 89
 12
 17
 21
 14
Serotype 16F
 3341
 23
 12
 4
 1
 6
 12
 74

3407
 23
 189
 4
 12
 43
 4
 74

3408
 23
 189
 4
 12
 15
 241
 74

3419
 6
 189
 4
 12
 15
 241
 74
Serotype 18C
 1233
 10
 11
 34
 16
 15
 1
 145
Serotype 18F
 2425
 10
 5
 34
 16
 36
 142
 31
Serotype 19A
 202
 8
 16
 19
 15
 6
 40
 26

847
 7
 11
 4
 1
 6
 112
 14

2174
 7
 16
 8
 8
 6
 142
 14

3327
 7
 11
 4
 10
 6
 112
 14

3326
 7
 11
 4
 1
 6
 112
 15

3330
 7
 16
 4
 1
 6
 112
 14

3315
 5
 6
 1
 2
 6
 1
 5

3331
 7
 16
 8
 8
 4
 142
 14
Serotype 19F
 3307
 2
 5
 4
 10
 6
 1
 14

3340
 16
 16
 19
 1
 6
 20
 33
Serotype 20
 1734
 5
 31
 8
 1
 27
 1
 31

3316
 6
 5
 2
 5
 67
 49
 18
Serotype 21
 1746
 10
 13
 4
 16
 15
 1
 6
Serotype 22
 910
 5
 5
 6
 5
 9
 17
 19

2214
 5
 5
 4
 4
 11
 19
 18
Serotype 23F
 802
 10
 13
 53
 1
 72
 38
 31

1526
 7
 13
 8
 6
 25
 1
 8

3343
 7
 13
 53
 1
 72
 38
 14

3410
 118
 8
 4
 12
 72
 19
 5
Serotype 29
 2942
 12
 111
 34
 84
 19
 83
 6
Serotype 33
 445
 2
 5
 29
 5
 42
 3
 18

3308
 2
 5
 29
 18
 13
 3
 18
Serotype 35B
 3329
 7
 13
 4
 8
 6
 20
 18

3328
 7
 13
 4
 8
 6
 1
 18
Serotype 38
 310
 1
 43
 41
 18
 13
 49
 6

3306
 1
 43
 41
 18
 13
 49
 5
Serotype 45
 3332
 8
 15
 89
 1
 19
 1
 6
Serotype 46
 3334
 12
 5
 53
 8
 7
 27
 14

Antonio et al. BMC Infectious Diseases 2008 8:81   doi:10.1186/1471-2334-8-81