Table 2

Variant sites found in mtDNA CR (16531 nt – 261 nt). For each haplotype the absolute frequency in centenarians (A) and controls (B) is reported. The number of subjects showing DHPLC heteroplasmy levels higher than 5% is reported in parenthesis. rCRS refers to the revised Cambridge Reference Sequence [28].

Nt

20

55

57

64

72

73

93

114

143

146

150

151

152

153

182

185

188

189

191

194

195

198

199

200

204

207

217

225

226

227

228

235

239


rCRS

A

T

T

C

T

A

A

C

G

T

C

C

T

A

C

G

A

A

A

C

T

C

T

A

T

G

T

G

T

A

G

A

T


A

B

27(14)

18(3)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

2 (1)

0

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

3 (3)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

-

21(8)

24(6)

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

5 (3)

7 (4)

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (0)

0

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

2 (0)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

G

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

7 (6)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

A

C

-

-

-

-

4 (4)

7 (1)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

A

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

A

C

-

-

G

-

1 (1)

2 (0)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (0)

0

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

-

2 (2)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

T

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

3 (1)

2 (2)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

-

1 (0)

0

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (0)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

A

C

-

-

-

-

1 (0)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

A

C

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

2 (1)

0

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (0)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

1 (1)

6 (5)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

T

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

T

-

G

-

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

A

C

-

-

-

-

1 (0)

0

-

C

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

2 (1)

0

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

2 (0)

7 (1)

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (0)

0

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

A

-

G

-

-

-

1 (1)

2 (2)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

G

-

-

C

-

-

-

C

A

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

C

-

G

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

4 (2)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (0)

1 (0)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1 (1)

0

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

2 (1)

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (0)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

-

0

1 (0)

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

3 (3)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

C

-

-

A

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (1)

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (1)

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (1)

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

5 (2)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

2 (1)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (0)

-

-

-

T

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (0)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A

-

-

0

1 (0)

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

2 (2)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

T

-

C

-

-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (1)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

G

-

T

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (1)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

G

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

0

1 (1)

-

-

-

-

-

G

-

-

-

C

T

-

C

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-


Rose et al. BMC Genomics 2007 8:293   doi:10.1186/1471-2164-8-293

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