Table 5

Specific genes expressed in the brain

Tissues from GEO and accession number

Tag

Testis

Prostate

Ovary

Mammary gland

Uterus

Vagina

Skin

Liver

Adipose tissue

Lung

Bone

Skeletal muscle

Cerebral cortex

Hypothalamus

Pituitary gland

Mouse embryonic fibroblasts GSM7759

Heart normal GSM106587

Thymus normal GSM106596

Bladder normal GSM106599

Kidney normal GSM56242

Spleen normal GSM106591

Pancreas Normal GSM106592

Intestine UniGene and EST expression (%)

Description [UniGene cluster, GenBank Accession No]

General function

Cerebral cortex

GTCGTCCTCTA

2^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

0^a

0^a

47

0^a

0^a

0^a

1^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 7 [Mm.255631, NM_182993]

Transport

TGACCTTGGCC

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

41

1^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

gene model 748, (NCBI) [Mm.102203, AK122363]

Protein binding and heme Binding

GTACTTGGCTG

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

24

1^a

2^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

synaptic vesicle glycoprotein 2 b [Mm.273082, NM_153579]

Transporter activity

Hypothalamus

TTGGCAAGTCT

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

198

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

RIKEN cDNA A230109K 23 gene [Mm.200361, BC048534]

neurotransmitter or neuromodulator

TGTGACGCTGG

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

37

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

cocaine and amphetamine regulated transcript [Mm.75498, NM_013732]

Cell signaling

AGTTCCTTCGC

0^a

1^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

34

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

calbindin 2 [Mm.2755, NM_007586]

Calciunion binding

GGCCGCCGCGC

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

33

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

hypocretin [Mm.10096, NM_010410]

Cell signaling

Pituitary gland

AAGTGTCGCCG

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

14963

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

growth horm one [Mm.343934, NM_008117]

Cell signaling

GGCGAGCTGAT

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

0^a

0^a

1^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1496

0^a

1^a

0^a

0^a

2^a

0^a

0^a

0

Pro-opiomelanocortin-alpha [Mm.277996, NM_008895]

Cell signaling

GCGGGAAAAGC

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

1383

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

CTTGGGTGCAA

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1307

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

prolactin [Mm.1270, NM_011164]

Cell signaling

AAGTGTCGCCT

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

601

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

TTGGCGTCAAA

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

436

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

AAGTGTCGCCA

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

408

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

TCGGTTCTCTG

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

329

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

ACGTACTTCCG

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

222

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

CGCAGCGACGA

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

218

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

GCTGGGGCCCG

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

194

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

ACCCGCAGGTA

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

114

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

NM

Novel transcript

GTCCGAGTACT

2^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

1^a

0^a

0^a

0^a

0^a

75

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

luteinizing hormone beta [Mm.57061, NM_008497]

Cell signaling

TTACTCCTTAT

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

49

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0^a

0

thyroid stimulating hormone, beta subunit [Mm.110730, NM_009432]

Thyroid structure and metabolism

^a Significant difference vs. no. of tags shown in bold (p < 0,05)

Kouadjo et al. BMC Genomics 2007 8:127   doi:10.1186/1471-2164-8-127