Table 5

Specific genes expressed in the brain

Tissues from GEO and accession number


Tag

Testis

Prostate

Ovary

Mammary gland

Uterus

Vagina

Skin

Liver

Adipose tissue

Lung

Bone

Skeletal muscle

Cerebral cortex

Hypothalamus

Pituitary gland

Mouse embryonic fibroblasts GSM7759

Heart normal GSM106587

Thymus normal GSM106596

Bladder normal GSM106599

Kidney normal GSM56242

Spleen normal GSM106591

Pancreas Normal GSM106592

Intestine UniGene and EST expression (%)

Description [UniGene cluster, GenBank Accession No]

General function


Cerebral cortex

GTCGTCCTCTA

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

47

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0

solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 7 [Mm.255631, NM_182993]

Transport

TGACCTTGGCC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

41

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

gene model 748, (NCBI) [Mm.102203, AK122363]

Protein binding and heme Binding

GTACTTGGCTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

24

1a

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

synaptic vesicle glycoprotein 2 b [Mm.273082, NM_153579]

Transporter activity

Hypothalamus

TTGGCAAGTCT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

198

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

RIKEN cDNA A230109K 23 gene [Mm.200361, BC048534]

neurotransmitter or neuromodulator

TGTGACGCTGG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

1a

37

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

cocaine and amphetamine regulated transcript [Mm.75498, NM_013732]

Cell signaling

AGTTCCTTCGC

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

34

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

calbindin 2 [Mm.2755, NM_007586]

Calciunion binding

GGCCGCCGCGC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

33

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

hypocretin [Mm.10096, NM_010410]

Cell signaling

Pituitary gland

AAGTGTCGCCG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

14963

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

growth horm one [Mm.343934, NM_008117]

Cell signaling

GGCGAGCTGAT

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1496

0a

1a

0a

0a

2a

0a

0a

0

Pro-opiomelanocortin-alpha [Mm.277996, NM_008895]

Cell signaling

GCGGGAAAAGC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

1383

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

CTTGGGTGCAA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1307

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

prolactin [Mm.1270, NM_011164]

Cell signaling

AAGTGTCGCCT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

601

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

TTGGCGTCAAA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

436

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

AAGTGTCGCCA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

408

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

TCGGTTCTCTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

329

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

ACGTACTTCCG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

222

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

CGCAGCGACGA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

218

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

GCTGGGGCCCG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

194

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

ACCCGCAGGTA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

114

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

GTCCGAGTACT

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

75

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

luteinizing hormone beta [Mm.57061, NM_008497]

Cell signaling

TTACTCCTTAT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

49

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

thyroid stimulating hormone, beta subunit [Mm.110730, NM_009432]

Thyroid structure and metabolism


a Significant difference vs. no. of tags shown in bold (p < 0,05)

Kouadjo et al. BMC Genomics 2007 8:127   doi:10.1186/1471-2164-8-127

Open Data