Table 4

Specific genes expressed in the skin, liver, adipose tissue, lungs, bone, and skeletal muscle

Tissues from GEO and accession number


Tag

Testis

Prostate

Ovary

Mammary gland

Uterus

Vagina

Skin

Liver

Adipose tissue

Lung

Bone

Skeletal muscle

Cerebral cortex

Hypothalamus

Pituitary gland

Mouse embryonic fibroblasts GSM7759

Heart normal GSM106587

Thymus normal GSM106587

Bladder normal GSM106599

Kidney normal GSM56242

Spleen normal GSM106591

Pancreas normal GSM 106592

Intestine UniGene and EST expression (%)

Description [UniGene cluster, GenBank Accession No]

General function


Skin

ATTCCCTGTTA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

299

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin associated protein 8-1 [Mm.13979, D86423]

Cell structure

AAGTGAAAGCA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

204

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

trichohyalin – human [Mm.1160, CD545918]

Fibrillar forming collagen

CCTCCATTTCC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

86

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin complex 1, acidic, gene 4 [Mm.289644, NM_027563]

Cell structure

GTTCTCAGTAT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

66

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin associated protein 6-1 [Mm.310892, D86419]

Cell structure

TTGCTTCTGGG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

65

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin associated protein 3-2 [Mm.46389, NM_025720]

Cell structure

AAGCTTTGATA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

59

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin associated protein 16-5 [Mm.28425, NM_130857]

Cell structure

GCTTCACCTTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

40

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin associated protein 11-1 [Mm.310906, AV018433]

Cell structure

ATGGTCTGAGC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

40

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

S100 calcium binding protein A17 [Mm.68064, NM_027762]

Cell signaling

CAACTCCTTTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

35

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin complex 1, acidic, gene 1 [Mm.19109, NM_010659]

Cell structure

GGCCTGGCTTA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

35

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

lymphocyte antigen 6 complex, locus G6C [Mm.215096, NM_023463]

Cell defence

GTACTGTCTTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

34

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

keratin associated protein 4.7 (Homo sapiens) [Mm.340791, AV089658]

Cell structure

TCCTGCACAAT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

25

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

G protein-coupled receptor, family C, group 5, member D [Mm.49902, NM_053118]

Cell signaling

Liver

AAGACTCAGGA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

185

0a

0a

3a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

albumin 1 [Mm.16773, NM_009654]

Cell defence

TCGGACCATAG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

120

1a

0a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

alpha 1 microglobulin/bikunin [Mm.2197, NM_007443]

Cell defence

CAAATAGGTTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

101

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade A, member 1a [Mm.259233, AI527352]

Cell defence

ACCCTTAGAGA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

93

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

betaine-homocysteine methyltransferase [Mm.329582, NM_016668]

Amino acid metabolism

GCCACGCCCCC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

89

1a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

4-hydroxyphenylpyruvic acid dioxygenase [Mm.6584, NM_008277]

Amino acid metabolism

GTGATTGCTGA

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

79

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

murinoglobulin 2 [Mm.244937, NM_008646]

Cell defence

TGTTCCGTCTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

67

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

coagulation factor II [Mm.89048, NM_010168]

Cell defence

TTTCTTAAATC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

67

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

esterase 31-like [Mm.347422, NM_144511]

Cell defence

TTGTCCTCGTA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

61

0a

2a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4 [Mm.211681, NM_018746]

Cell defence

GCGATGAAATC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

59

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

esterase 1 [Mm.88078, AI256598]

Cell defence

CTCATCGTATG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

57

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

GGCACCTTCAC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

56

1a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

peptidoglycan recognition protein 4 [Mm.316644, XM_357978]

Cell defence

GAGCTGTTTCT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

56

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 40 [Mm.335940, NM_010004]

Steroid hormone synthesis

TTGCAAGGCTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

46

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0

albumin 1 [Mm.16773, AI747247]

Cell defence

GAGCTCTTCCT

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

45

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 26 [Mm.29064, NM_029562]

Steroid hormone synthesis

AGACCTTGGGA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

44

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

kininogen 2 [Mm.2160, NM_023125]

Cell defence

GTTGCTGACCG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

43

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

plasminogen [Mm.971, NM_008877]

Protein synthesis

AAAACAGAAAA

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

39

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

TGTGTTATTTT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

35

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

regucalcin [Mm.2118, NM_009060]

Regulation of enzymatic activity

AAAGTCCTCGA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

34

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

aldo-keto reductase family 1, member C6 [Mm.196666, NM_030611]

Catalytic activity

GATACAGACTA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

33

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

GACACACACTA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

32

0a

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

ACATTTCCAGA

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

28

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

2a

0a

0a

0

silica-induced gene 111 [Mm.330825, AV058272]

promoting cell survival

GGGACATTCGG

0a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

25

0a

1a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 2 [Mm.290044, BC013442]

Transport

AAATTATTCCT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

24

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

major urinary protein 1 [Mm.335875, AW110035]

Cell defence

Adipose tissue

CCAGCACTCAA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

31

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

leptin [Mm.277072, NM_008493]

Cell signaling

TACCTTTCATA

0a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

29

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

7

lectin, galactose binding, soluble 12 [Mm.298242, NM_019516]

Cell division

Lung

CAAGGATCTAC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

85

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

surfactant associated protein D [Mm.1321, NM_009160]

Cell defence

TGTCTGCCTCT

0a

1a

0a

0a

0a

0a

1a

1a

1a

45

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

claudin 18 [Mm.35090, AK033657]

Cell signaling

ACCCACACTCC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

40

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

surfactant associated protein A1 [Mm.46062, NM_023134]

Cell defence

GCTCACAGAAA

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

35

0a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

palate, lung, and nasal epithelium carcinoma associated [Mm.268852, NM_011126]

Cell defence

GGCATCCCATT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

31

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

secretoglobin, family 3A, member 1 [Mm.22802, NM_170727]

Cell defence

Bone

CTTTCCTGGGT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

144

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

proteoglycan 2, bone marrow [Mm.142727, NM_008920]

Cell defence

TTTTGGGCACA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

1a

0a

0

122

0a

0a

0a

0a

0a

4a

0a

0a

0a

0a

0a

0

solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1 [Mm.7248, NM_011403]

transport

TATGTGGACTG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

2a

1a

0a

59

0a

1a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0

proteinase 3 [Mm.2364, NM_011178]

Cell defence

TGCCGCCGTCG

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

52

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

neutrophil elastase [Mm.262194, BX632826]

Cell defence

ACAGGAAGAGC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

39

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

eosinophil peroxidase [Mm.1315, NM_007946]

Cell defence

CCCTGGATCAA

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

29

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

cathepsin G [Mm.4858, NM_007800]

Cell defence

CTGAGGTGGGC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

25

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

claudin 13 [Mm.86652, NM_020504]

Cell signaling

GAAATATTCAC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

25

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 3 [Mm.119630, NM_133246]

Cell defence

AAAGTGTGACC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

25

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

72

carbonic anhydrase 1 [Mm.273195, NM_009799]

Cell defence

Skeletal muscle

TGGAACGAGCA

0a

1a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

1a

68

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

TGGGCAGCCTT

0a

0a

0a

0a

0a

0a

2a

0a

0a

0a

1a

58

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

myosin light chain, phosphorylatable, fast skeletal muscle [Mm.14526, AV165375]

Cell structure

GACCTGAGGGC

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

0a

41

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

ACCTCTATATA

0a

0a

0a

2a

0a

0a

1a

0a

0a

1a

0a

38

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

tropomyosin 3, gamma [Mm.240839, U04541]

Cell structure


a Significant difference vs. no. of tags shown in bold (p < 0,05)

Kouadjo et al. BMC Genomics 2007 8:127   doi:10.1186/1471-2164-8-127

Open Data