Table 2

Specific genes expressed in the male sexual organs

Tissues from GEO and accession number


Tag

Testis

Prostate

Ovary

Mammary gland

Uterus

Vagina

Skin

Liver

Adipose tissue

Lung

Bone

Skeletal muscle

Cerebral cortex

Hypothalamus

Pituitary gland

Mouse embryonic fibroblasts GSM7759

Heart normal GSM106587

Thymus normal GSM106587

Bladder normal GSM106599

Kidney normal GSM56242

Spleen normal GSM106591

Pancreas normal GSM 106592

Intestine UniGene and EST expression (%)

Description [UniGene cluster, GenBank Accession No]

General function


Testis

TCGATGTCTGA

1221

0a

4a

0a

0a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

protamine 2 [Mm.325769, NM_008933]

Cell signaling

AGGACATCAGA

601

0a

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

transition protein 1 [Mm.661, NM_009407]

Cell signaling

AAACAGAGTCT

391

0a

2a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

t-complex-associated testis expressed 3 [Mm.272173, NM_011560]

Cell signaling

GTGCCAGGAGA

241

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

GGTCTGGCTGG

234

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

tubulin, alpha 3 [Mm.287784, NM_009446]

Cell signaling

GCTCCACTGGT

227

0a

0a

0a

0a

8

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

diazepam binding inhibitor-like 5 [Mm.347413, BC048474]

Cell signaling

ACCGCTGAGGA

222

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

lactate dehydrogenase 3, C chain, sperm specific [Mm.16563, NM_013580]

Energy metabolism

TGCAACTGGCC

201

0a

0a

0a

1a

2a

1a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

2a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0

outer dense fiber of sperm tails 2 [Mm.330116, NM_013615]

Cell defence

TTCCATCTCTG

190

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

ornithine decarboxylase antizym e 3 [Mm.331200, NM_016901]

Amoni acid metabolism

TTTAGCCGAGA

180

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, sperm atogenic [Mm.1729, NM_008085]

Energy metabolism

TACACGAGGAT

178

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

transition protein 2 [Mm.206798, NM_013694]

Cell signaling

GCCAGATACCG

139

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

protamine 1 [Mm.42733, NM_013637]

Cell signaling

GATTAAAGCTT

134

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

transition protein 2 [Mm.206798, NM_013694]

Cell signaling

GCGTGCTCAGA

132

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

RIKEN cDNA 4921511K06 gene [Mm.251303, AK160245]

Cytokinesis, cell shape, secretion and capping

TAGCCCCTGCA

125

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

outer dense fiber of sperm tails 1 [Mm.252830, NM_008757]

Cell defence

CCCTTTTTCAA

123

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein [Mm.331192, NM_008574]

Sperm motility

CAGGAACACGG

111

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

GTCGACCGATG

100

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

meiosis expressed gene 1 [Mm.2688, CN833209]

Potein binding

CAGCTCAAGTG

99

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

ATPase, C lass I, type 8B, member 3 [Mm.52511, NM_026094]

Energy metabolism, transport

CCAATTGCTAC

95

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

histone H1-like protein in spermatids 1 [Mm.30482, NM_018792]

Cell division

TCGGTGCCTCT

88

0a

2a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

DnaJ (H sp40) homolog, subfamily B, member 3 [Mm.3075, NM_008299]

Cell defence

GTGCTGGCTTG

88

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

ACACCCACGCG

83

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

sperm atogenic Zip 1 [Mm.23520, NM_030237]

Transcription factor activity

AAAAAGACCAA

81

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

centrin 1 [Mm.195831, NM_007593]

Cell structure

AAGGCCTGCCA

78

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

chaperonin containing TC P1, subunit 4 [Mm.332809, BU962071]

Cell protein synthesis

AACAATGTTGT

72

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

fatty acid binding protein 9, testis [Mm.26654, NM_011598]

Lipid metabolism

TTCAGCAACGG

72

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

t-complex protein 10b [Mm.326683, NM_011553]

Cell signaling

TCTCGCAATGG

63

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

tubby-like protein 2 [Mm.280778, NM_008807]

Phosphoric diester hydrolase Activity

CTGGATGGTTT

60

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

actin-like 7b [Mm.251434, NM_025271]

Cell structure

ACCTGCAGCCT

58

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

heat shock protein, alpha-crystallin-related, B9 [Mm.46175, XM_126494]

Cell defence

AACAAAAATCC

58

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

3

0a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

testis specific gene A2 [Mm.12743, NM_025290]

Cell signaling

CGCGGAATGCT

56

0a

0a

0a

1a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

PH D finger protein 7 [Mm.5348, BY099053]

Protein synthesis

TCTTGCGGCGG

55

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

DnaJ (H sp40) homolog, subfamily B, member 3 [Mm.3075, AK005688]

Cell defence

GAGCAGGTCCA

48

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

kinesin family member 2B [Mm.67677, XM_126653]

Cell structure

TCTTCTGCCTC

46

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

serine/threonine kinase 22B (sperm iogenesis associated) [Mm.310201, NM_009436]

Metabolism: protein modification

GTGTGCGGACC

44

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

2a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

sperm associated antigen 4 [Mm.81035, AK028080]

Cell defence

AATCCATCCAG

44

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

thioredoxin domain containing 2 (sperm atozoa) [Mm.255732, NM_153519]

Cell defence

GCTCCTTTAAA

42

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

cytochrome coxidase, subunit VIIIc [Mm.660, XM_354691]

Energy metabolism

ACCTAGGCAGA

42

0

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

testis specific gene A8 [Mm.143832, AB032764]

Rhabdomere development and photoreceptor cell survival

CTAATCAGGAG

41

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

thioredoxin reductase 1 [Mm.210155, NM_025499]

Cell defence

CAAGAGCCTCA

41

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

selenoprotein W [Mm.212777, NM_175033]

Cell defence

TGCCCCAACAT

41

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

oxysterol binding protein 2 [Mm.348003, BC058602]

Transport

CACGAAGTTCC

39

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

neighbor of Brca1 gene 1 [Mm.784, AF227188]

Zing and ion binding

ATAGGATGCTG

37

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

tudor domain containing 6 [Mm.329058, NM_198418]

Oogenesis

GCTTGAAGCCT

35

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

serine/threonine kinase 22A (sperm iogenesis associated) [Mm.347554, XM_147244]

Metabolism: protein modification

GTGCCTACCTA

33

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

1a

0a

0a

1a

1a

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

Park2 co-regulated [Mm.18889, XM_128418]

Sperm differentiation

TGGGTGAAGGG

33

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

tripartite motif protein 17 [Mm.179733, NM_031172]

Ubiquitin-protein ligase activity

GAAATCTTATG

33

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

four and a half LIM domains 5 [Mm.87325, NM_021318]

Transcription

GACAAGCAGAC

32

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

1a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

translin-associated factor X (Tsnax) interacting protein 1 [Mm.28323, NM_024445]

Protein binding

AGGGTGGACAA

30

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

DnaJ (H sp40) homolog, subfamily B, member 8 [Mm.272871, NM_019964]

Cell defence

GGCTCAATTTC

30

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

StAR -related lipid transfer (STAR T) domain containing 6 [Mm.83623, BC061022]

Cell signaling

TGTTCTTCACT

30

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

sperm associated antigen 9 [Mm.260737, AK034670]

Cell defence

CCCTGGGAGAC

30

0a

2a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

1

0a

1a

1a

2a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

sterile alpha motif domain containing 4 [Mm.269139, XM_127686]

Post-transcriptional regulators

GTCGCTGTCTT

28

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

fibronectin type 3 and ankyrin repeat domains 1 [Mm.87448, AK017071]

Transcription factor activity and DNA binding

CCTTCTGTCGG

28

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

t-complex protein 10b [Mm.326683, NM_009340]

Cell signaling

GCTACGCTCAC

28

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

dipeptidase 3 [Mm.173395, NM_027960]

Protein synthesis

CAGACCAACGC

28

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

testis specific 10 interacting protein [Mm.329659, AK019010]

Cell signaling

ATGCCTTTCCA

26

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

ankyrin repeat domain 5 [Mm.198389, NM_175667]

Cell structure

AACAATATTTA

26

0a

0a

0a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

ubiquitin-conjugating enzyme E2N [Mm.328239, AK005788]

Protein synthesis

GCTGCATAACA

26

0a

0a

0a

0a

0a

0a

3

1a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

aquaporin 11 [Mm.29756, NM_175105]

Transport

Prostate

0a

ACCCAGACACG

0a

193

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

seminal vesicle protein, secretion 2 [Mm.99395, BB872622]

Protein secretion

TGACAAAACGT

0a

99

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

beta-microseminoprotein [Mm.2540, NM_020597]

Cell signaling

AAGACGGGTAG

0a

91

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

C U B and zona pellucida-like domains 1 [Mm.304207, BE852974]

Cell signaling

GCAACTAGCCT

0a

66

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

serine peptidase inhibitor, Kazal type 3 [Mm.272, DV071569]

Peptidase activity

GTGAGAAACAC

0a

52

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

NM

Novel transcript

TATTTTGCAAT

0a

49

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

seminal vesicle antigen [Mm.4119, NM_009299]

Protein secretion

CCTGGTGAAAG

0a

45

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

1a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0a

0

mucin 10, submandibular gland salivary mucin [Mm.200411, NM_008644]

Spermatogenesis


a Significant difference vs. no. of tags show n in bold (p < 0,05)

Kouadjo et al. BMC Genomics 2007 8:127   doi:10.1186/1471-2164-8-127

Open Data