Table 1

The AUC of CTF, Chromia and PWM on the dataset of 13 TFs

CTF

Chromia

PWM


c-Myc

0.98

0.94

0.84


CTCF

0.76

0.69

0.76


E2f1

0.96

0.94

0.75


Esrrb

0.89

0.84

0.77


Klf4

0.96

0.92

0.83


Nanog

0.83

0.82

0.62


n-Myc

0.97

0.94

0.86


Oct4

0.92

0.88

0.61


Smad1

0.92

0.89

0.66


Sox2

0.90

0.87

0.70


STAT3

0.91

0.86

0.72


Tcfcp2l1

0.88

0.83

0.79


Zfx

0.97

0.96

0.82


Average

0.91

0.88

0.75


He et al. BMC Genomics 2012 13(Suppl 8):S18   doi:10.1186/1471-2164-13-S8-S18

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