Table 1

Length distribution of assembled contigs, scaffolds and Unigenes
Nucleotide length (bp) Contigs Scaffolds Unigenes
75-100 68000 425 0
101-200 63846 46435 21289
201-300 29886 24243 24376
301-400 12723 10954 10941
401-500 7061 6508 6463
501-600 4368 4226 4242
601-700 3013 3010 2987
701-800 2138 2137 2150
801-900 1500 1650 1627
901-1000 1270 1434 1431
1001-1100 1010 1108 1105
1101-1200 870 965 959
1201-1300 691 781 786
1301-1400 598 788 783
1401-1500 469 584 584
1501-1600 362 481 468
1601-1700 312 457 471
1701-1800 237 360 360
1801-1900 213 329 332
1901-2000 185 307 302
2001-2100 148 254 254
2101-2200 114 195 197
2201-2300 102 194 187
2301-2400 72 157 159
2401-2500 68 143 144
2501-2600 46 100 93
2601-2700 49 91 91
2701-2800 29 70 73
2801-2900 29 69 66
2901-3000 23 42 41
>3000 92 289 287
Total 199,524 108,786 83,248
Minimum length (bp) 75 100 150
Maximum length (bp) 5144 5144 5144
Average length (bp) 235 375 449
Total nucleotide length (bp) 46,788,615 40,835,227 37,402,485

Huang et al.

Huang et al. BMC Genomics 2012 13:648   doi:10.1186/1471-2164-13-648

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