Table 1

Previously unknown candidate miRNA genes identified in the tammar using Meug_1.0 annotations
miRNA count Ensembl Meug 1.0 annotation Symbol Hairpin alignment mRNA
26 ENSMEUG00000003103 novel ..((((.((((..(((.(((((((((((((((.((.......)).))))))))…))))))).)))..))))))))…((((((((.....)))).)))) X
13 ENSMEUG00000016107 novel ..((((…(((((((.((((((((((.(((((((.((.......)).)))))))..))))))).....((((((...))))))))).))))))).))))… X
13 ENSMEUG00000014431 novel …(((.(((((....((((...))))))))).))).((((((((…))))))))…(((((((.(((.(((.......))).))).))..))))).....
13 ENSMEUG00000013419 novel ...((((.(((...)))…))))....((.(((((((((((((((((((((.......)))))…)))).)).)))).)))))).))........ X
13 ENSMEUG00000010899 novel .....(((((((((((((.(((..(((.....(((((.(((.(((((((((.......)))))))))))))))))))).))).)))))...))).)))))
13 ENSMEUG00000010593 novel .(((((.(((((..((((((.((((((((((((.((.......)).))))))…))))))...((.(((((…))))).))))))))...)))))…))))) X
13 ENSMEUG00000010192 novel .(((.(((…((((((((((…(((((.(((..........)))))))).))))))))))((.(((((…))))).))…((((...)))).))).)))..
13 ENSMEUG00000008728 novel .((((…(((((((.((((...((.(((......))).))…))))))))))).)))).((((((((((((((((.....)))))))..)))))))))...
13 ENSMEUG00000005907 novel (((.((.(((…((.(((((((((((.(((((((((.......))))).))))...)))))))…)))).)).))).)))))............
13 ENSMEUG00000003443 novel ...((.(((((..))).)).))…((.((((((((.(((((((((…((((((((.(((.......))).)))))))))))))))...)).))).))))).)). X
13 ENSMEUG00000002502 novel .(((((…(((.((.((((((((((((.(((((((.((.......)).)))))))..))))))).((((..))))))))).)))))...)))))...... X
13 ENSMEUG00000001788 novel ((((..))))((((((.((((((((((((((((((.((.......)).)))))))))…)))))).((((.......))))....))).))))))... X
13 ENSMEUG00000000143 novel …(((((.(((.((((......)))).))).)))))(((((((…)))))))....(((((...((((.(((((((...))))))).))))...))))). X

Note that there are no miRBase orthologs.

Lindsay et al.

Lindsay et al. BMC Genomics 2012 13:559   doi:10.1186/1471-2164-13-559

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