Table 2

Start and stop codons used in mitochondrial protein-coding genes
Wolbachia-dependent species Wolbachia-independent species
B. malayi D. immitis O. volvulus W. bancrofti A. viteae L. loa O. flexuosa C. quiscali S. digitata
ND2 TTA/T ATT/TAG ATT/TAG TTA/T TTT/TAG ATT/TAA ATT/TAG ATT/TAG TTT/TAG
ND4 TTG/TAA TTG/TAG TTG/TAA TTG/TAA ATG/TAA TTG/TAG TTG/TAG TTG/TAA ATG/TAA
COX1 ATT/TAG ATT/TAG ATT/TAG ATT/TAA GTT/T GTT/T ATT/TAA TTG/TAA ATT/TAG
ND6 TAT/TAA TAT/TAG ATT/TAG TGT/TAA TAT/TAG TAT/TAG ATT/TAA TTG/TAG TTG/TAA
CYTB ATT/T GTT/T ATT/TAA ATT/T TCT/T ATT/T ATT/TAA ATT/T GTT/T
COX3 ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAG ATT/TAA ATA/T
NDL4 GTA/TAA GTA/TAA TTG/TAA GTA/TAA GTA/T GTA/T TTA/T GTT/TAA TTG/T
ND1 TTG/T TTG/T TTG/T TTG/TAA TTG/T TTG/T TTG/T TTG/T TTG/TAA
ATP6 ATT/TAG TTG/TAA ATT/TAG ATT/TAG ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAG TTT/TAG
COX2 ATT/TAA ATT/T ATT/TA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAA ATT/TAG
ND3 CTT/TAG CTT/T CTT/TAG CTT/T CTT/T CTT/T CCT/T CTT/TAG TTT/T
ND5 TTT/TAG TTG/TAG TTG/TAG TTT/TAG TTT/TAG TTT/TAG TTA/TAA TTT/T TTT/TAG

Information was taken from previous studies for B. malayi[24], D. immitis[23], O. volvulus[22], and S. digitata[25]. Information regarding the Wolbachia status of species from various subfamilies is reported in [2].

McNulty et al.

McNulty et al. BMC Genomics 2012 13:145   doi:10.1186/1471-2164-13-145

Open Data