Table 2

Compositional comparison of Core Islands r1-r5 (with relative dissimilarities of 10%) of Rhodobacter sphaeroides with each other (underlined), and Genomic Islands with each other (bold)

Genomic dissimilarity values (δ*)

Start coordinate

End coordinate

size (bp)

R. sphaeroides

    r1

    r2

    r3

    r4

    r5

GI1

GI3

GI4


R. sphaeroides

0

3217726

3217726

0

16,3

16,9

16,8

16,8

16,9

42,1

40,6

44,0

    r1

2400000

2415000

15001

16,3

    0

    25,9

    26,2

    22,1

    29,9

41,7

43,7

45,9

    r2

990000

1005000

15001

16,9

    25,9

    0

    31,0

    31,1

    23,8

48,1

46,2

47,1

    r3

1620000

1635000

15001

16,8

    26,2

    31,0

    0

    25,8

    20,3

41,8

46,4

51,1

    r4

2910000

2925000

15001

16,8

    22,1

    31,1

    25,8

    0

    21,0

29,6

33,1

33,5

    r5

2310000

2325000

15001

16,9

    29,9

    23,8

    20,3

    21,0

    0

43,8

40,2

40,0

GI1

2883355

2905795

22440

42,1

41,7

48,1

41,8

29,6

43,8

0

16,9

18,9

GI3

2085503

2112636

27133

40,6

43,7

46,2

46,4

33,1

40,2

16,9

0

12,8

GI4

1575936

1597159

21223

44,0

45,9

47,1

51,1

33,5

40,0

18,9

12,8

0


Roos and van Passel BMC Genomics 2011 12:427   doi:10.1186/1471-2164-12-427

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