Table 5 |
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Distribution of perfect synteny blocks between C. elegans chromosomes (rows) and C. briggsae chromosomes (columns). |
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Chromosome |
ChrI |
ChrII |
ChrIII |
ChrIV |
ChrV |
ChrX |
ChrUn |
Total |
Non-homologous |
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I |
325 (89) |
9 (0) |
0 (0) |
3 (0) |
2 (0) |
0 |
17 |
445 |
14 |
|
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|
II |
13 (0) |
370 (40) |
1 (2) |
28 (1) |
37 (2) |
3 |
28 |
525 |
87 |
|
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|
III |
3 (0) |
13 (0) |
364 (14) |
7 (0) |
18 (0) |
0 |
23 |
442 |
41 |
|
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|
IV |
13 (3) |
8 (9) |
2 (1) |
423 (12) |
22 (3) |
10 |
19 |
525 |
71 |
|
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|
V |
17 (0) |
3 (1) |
1 (0) |
41 (0) |
520 (72) |
4 |
31 |
690 |
67 |
|
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|
X |
0 (0) |
2 (0) |
0 (0) |
0 (0) |
6 (0) |
417 |
6 |
431 |
8 |
|
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Total |
371 (92) |
405 (50) |
368 (17) |
502 (13) |
605 (77) |
434 |
124 |
3,058 |
288 |
|
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Non-homologous |
46 (3) |
35 (10) |
4 (3) |
79 (1) |
85 (5) |
17 |
N.A. |
288 |
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Numbers in parenthesis correspond to the number of synteny blocks found in the "_random" assembly of the chromosome, as reported by Hillier and colleagues [21]. |
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Vergara and Chen BMC Genomics 2010 11:516 doi:10.1186/1471-2164-11-516 |
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