Table 2 |
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Allele and genotype frequencies |
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allele 01 (%) |
allele 02 (%) |
pc |
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TNFA-238a/g |
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CON (n = 375) |
726 (96.8) |
24 (3.2) |
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RA (n = 170) |
323 (95.0) |
17 (5.0) |
n.s. |
|
JRA (n = 130) |
254 (97.7) |
6 (2.3) |
n.s. |
|
TNFA-308a/g |
|||
|
CON (n = 312) |
527 (84.5) |
97 (15.5) |
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|
RA (n = 151) |
257 (85.1) |
45 (14.9) |
n.s. |
|
JRA (n = 122) |
202 (82.8) |
42 (17.2) |
n.s. |
|
TNFA-857c/t |
|||
|
CON (n = 415) |
738 (88.9) |
92 (11.1) |
|
|
RA (n = 191) |
343 (89.8) |
39 (10.2) |
n.s. |
|
JRA (n = 170) |
299 (87.9) |
41 (12.1) |
n.s. |
|
TNFR1-609g/t |
|||
|
CON (n = 324) |
384 (59.3) |
264 (40.7) |
|
|
RA (n = 173) |
221 (63.9) |
125 (36.1) |
n.s. |
|
JRA (n = 136) |
166 (61.0) |
106 (39.0) |
n.s. |
|
TNFR1 P12P |
|||
|
CON (n = 334) |
361 (54.0) |
307 (46.0) |
|
|
RA (n = 166) |
167 (50.3) |
165 (49.7) |
n.s. |
|
JRA (n = 132) |
154 (58.3) |
110 (41.7) |
n.s. |
|
TNFR2 del15 |
|||
|
CON (n = 428) |
621 (72.5) |
235 (27.5) |
|
|
RA (n = 190) |
255 (67.1) |
125 (32.9) |
0.1 |
|
JRA (n = 146) |
195 (66.7) |
97 (33.3) |
0.1 |
|
IKBL-332a/g |
|||
|
CON (n = 389) |
711 (91.4) |
67 (8.6) |
|
|
RA (n = 184) |
333 (90.5) |
35 (9.5) |
n.s. |
|
JRA (n = 170) |
316 (92.9) |
24 (7.1) |
n.s. |
|
IKBL-132t/a |
|||
|
CON (n = 389) |
555 (71.3) |
223 (28.7) |
|
|
RA (n = 177) |
263 (74.3) |
91 (25.7) |
n.s. |
|
JRA (n = 170) |
232 (68.2) |
108 (31.8) |
n.s. |
|
IKBL C224R |
|||
|
CON (n = 379) |
701 (92.5) |
57 (7.5) |
|
|
RA (n = 189) |
359 (95.0) |
19 (5.0) |
n.s. |
|
JRA (n = 169) |
320 (94.7) |
18 (5.3) |
n.s. |
|
CTLA4-318c/t |
|||
|
CON (n = 362) |
674 (93.1) |
50 (6.9) |
|
|
RA (n = 284) |
504 (88.7) |
64 (11.3) |
0.01 |
|
JRA (n = 197) |
342 (86.8) |
52 (13.2) |
0.001 |
|
CTLA4 T17A |
|||
|
CON (n = 362) |
455 (62.8) |
269 (37.2) |
|
|
RA (n = 284) |
346 (60.9) |
222 (39.1) |
n.s. |
|
JRA (n = 197) |
255 (64.7) |
139 (35.3) |
n.s. |
|
PTPRC P57P |
|||
|
CON (n = 347) |
684 (98.6) |
10 (1.4) |
|
|
RA (n = 195) |
382 (97.9) |
8 (2.1) |
n.s. |
|
JRA (n = 161) |
316 (98.1) |
6 (1.9) |
n.s. |
|
MIF-173g/c |
|||
|
CON (n = 390) |
616 (79.0) |
164 (21.0) |
|
|
RA (n = 168) |
285 (84.8) |
51 (15.2) |
0.05 |
|
JRA (n = 150) |
227 (75.7) |
73 (24.39) |
n.s. |
|
|
|||
|
CON: healthy controls, RA: adult RA patients, JRA juvenile RA patients |
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Miterski et al. BMC Genetics 2004 5:2 doi:10.1186/1471-2156-5-2 |
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