Table 5

Observed type I error rates when controlling for individual ancestry estimate, true ethnicity and self-reported ethnicity assuming various misclassification error rates when admixed population results from intermating between exactly two ancestral populations

Gap

Misclassification rate

Ethnicity

Admixture

SRE


0.05

0.067

0.046

0.402


0.05

0.075

0.087

0.041

0.46


0.1

0.089

0.061

0.432


0.125

0.083

0.059

0.42


0.15

0.071

0.047

0.427


0.05

0.061

0.054

0.517


0.2

0.075

0.075

0.059

0.52


0.1

0.077

0.051

0.518


0.125

0.063

0.045

0.517


0.15

0.067

0.055

0.492


0.05

0.058

0.05

0.631


0.35

0.075

0.06

0.056

0.622


0.1

0.067

0.051

0.657


0.125

0.06

0.052

0.62


0.15

0.054

0.044

0.642


0.05

0.064

0.066

0.752


0.5

0.075

0.061

0.063

0.767


0.1

0.043

0.038

0.787


0.125

0.05

0.043

0.783


0.15

0.062

0.064

0.765


Divers et al. BMC Genetics 2011 12:28   doi:10.1186/1471-2156-12-28

Open Data