Table 1

Haplotypic frequencies, allelic richness, and heterozygosities of MHC class I loci in 6 wild panda populations
Population
Locus Haplotype QLI (17) MSH (19) QLA (21) DXL (19) XXL (22) LSH (22)
Aime-C 01 / 0.026 0.016 0.100 / 0.043
02 0.368 0.250 0.250 0.067 0.107 0.357
03 0.079 0.355 0.375 0.200 0.196 0.143
04 / / 0.031 / 0.018 /
05 0.395 0.066 0.094 0.100 0.107 0.071
06 0.079 0.105 0.109 0.467 0.107 0.157
07 0.026 0.118 0.063 0.067 0.375 0.114
08 0.053 0.079 0.063 / 0.089 0.071
09 / / / / / 0.043
AR 5.736 6.498 7.018 6.000 6.497 7.519
HO 0.684 0.737 0.781 0.933 0.821 0.800
HE 0.711 0.785 0.804 0.738 0.792 0.812
Aime-F 01 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000
AR / / / / / /
HO / / / / / /
HE / / / / / /
Aime-I 01 0.125 0.134 0.212 0.250 0.290 0.256
02 0.438 0.500 0.455 0.219 0.210 0.207
03 / 0.073 0.091 0.125 0.129 0.098
04 0.188 0.232 0.167 0.375 0.113 0.256
05 / 0.061 0.030 0.031 0.145 0.073
06 0.146 / / / 0.097 0.073
07 0.104 / 0.045 / 0.016 0.037
AR 4.993 4.842 5.528 4.938 6.458 6.613
HO 0.626 0.732 0.758 0.625 0.774* 0.829
HE 0.741 0.734 0.777 0.756 0.832 0.814
Aime-L 01 0.021 0.012 0.121 0.094 0.032 0.049
02 0.167 0.226 0.303 0.219 0.226 0.232
03 0.292 0.262 0.273 0.188 0.210 0.244
04 0.146 0.286 0.106 0.156 0.113 0.244
05 / 0.024 0.030 0.031 0.065 /
06 0.375 0.190 0.167 0.250 0.129 0.171
07 / / / 0.063 0.226 0.061
AR 4.624 4.946 5.69 6.935 6.663 5.749
HO 0.792* 0.810 0.788 0.938 0.774 0.731
HE 0.740 0.789 0.803 0.843 0.824 0.802
Total AR 5.118 5.429 6.079 5.958 6.539 6.627
HO 0.701 0.760 0.776 0.832 0.790 0.787
HE 0.731 0.769 0.795 0.779 0.816 0.809

Notes: The predominant haplotype of each population is marked in bold. The figures in parentheses are the number of haplotypes in each population. Asterisks denote significant deviations from HWE (P < 0.05).

Zhu et al.

Zhu et al. BMC Evolutionary Biology 2013 13:227   doi:10.1186/1471-2148-13-227

Open Data