Table 4
Model results for the temporal lineage diversification of Carychium and Zospeum
model P df mtype LH r1 r2 a xp k st AIC ΔAIC
threshold
yule2rate r1, r2, st 3 RV 212.45 30.83 6.04 n.a. n.a. n.a. 0.0117 −418.90 0
DDL r1, k 2 RV 208.09 37.57 n.a. n.a. n.a. 68.32 n.a. −412.18 6.73
pureBirth r1 1 RC 206.58 23.71 n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. −411.16 7.74
DDX r1, xp 2 RV 206.61 26.44 n.a. n.a. 0.04 n.a. n.a. −409.21 9.69
bd r1, a 2 RC 206.58 23.71 n.a. 0.00 n.a. n.a. n.a. −409.16 9.74
ABGD
yule2rate r1, r2, st 3 RV 188.50 30.78 3.65 n.a. n.a. n.a. 0.0142 −371.00 0
DDL r1, k 2 RV 182.55 39.38 n.a. n.a. n.a. 53.63 n.a. −361.10 9.90
pureBirth r1 1 RC 180.28 21.97 n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. −358.56 12.44
DDX r1, xp 2 RV 180.40 27.75 n.a. n.a. 0.08 n.a. n.a. −356.81 14.20
bd r1, a 2 RC 180.28 21.97 n.a. 0.00 n.a. n.a. n.a. −356.56 14.44
SP
yule2rate r1, r2, st 3 RV 226.28 31.07 4.65 n.a. n.a. n.a. 0.0096 −446.56 0
DDL r1, k 2 RV 221.20 36.80 n.a. n.a. n.a. 78.07 n.a. −438.40 8.16
pureBirth r1 1 RC 220.00 24.58 n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. −438.01 8.56
bd r1, a 2 RC 220.00 24.58 n.a. 0.00 n.a. n.a. n.a. −436.01 10.56
DDX r1, xp 2 RV 220.00 24.58 n.a. n.a. 0.00 n.a. n.a. −436.01 10.56
GMYCs
yule2rate r1, r2, st 3 RV 285.59 31.68 9.37 n.a. n.a. n.a. 0.0040 −565.17 0
pureBirth r1 1 RC 283.47 29.02 n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. −564.93 0.24
DDX r1, xp 2 RV 283.78 20.50 n.a. n.a. −0.11 n.a. n.a. −563.56 1.61
bd r1, a 2 RC 283.52 26.48 n.a. 0.15 n.a. n.a. n.a. −563.04 2.14
DDL r1, k 2 RV 283.47 29.44 n.a. n.a. n.a. 1927.73 n.a. −562.94 2.23
GMYCm
bd r1, a 2 RC 385.03 16.10 n.a. 0.74 n.a. n.a. n.a. −766.06 0
DDX r1, xp 2 RV 384.37 12.05 n.a. n.a. −0.35 n.a. n.a. −764.75 1.31
yule2rate r1, r2, st 3 RV 385.23 30.56 71.35 n.a. n.a. n.a. 0.0042 −764.47 1.60
pureBirth r1 1 RC 381.35 35.94 n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. −760.69 5.37
DDL r1, k 2 RV 381.35 35.94 n.a. n.a. n.a. 11.20x10-3 n.a. −758.69 7.37

Results are shown for the five different molecular delimitation approaches. Model = model name; P = parameters included, df = degrees of freedom, mytpe = model type; rate-constant (RC) or rate-variable (RV), LH = model log likelihood, r1 = initial diversification rate, r2 = second diversification rate, a = extinction fraction, xp = the x-parameter from the DDX model, k = the k-parameter from the DDL model, st = shift-time, AIC = Akaike Information Criterion, ΔAIC = delta AIC, the difference in AIC scores between given model and the overall best-fit model, n.a. = not available.

Weigand et al. BMC Evolutionary Biology 2013 13:18   doi:10.1186/1471-2148-13-18

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