Table 3

Likelihood ratio test analysis and dN/dS ratios for MSTN-2a and MSTN-2b
Foreground branch P-value Likehood ratio test p0 p1 W0 W1
1 0.992953366 7.80E-05 0.85159 0.14839 0.11865 1
2 0.9953476 3.40E-05 0.85149 0.14837 0.11865 1
3 0.9953476 3.40E-05 0.85148 0.14837 0.11865 1
4 1 0 0.60715 0.10719 0.10494 1
5 1 0 0.70568 0.12296 0.11865 1.04992
6 0.998871621 2.00E-06 0.7009 0.12213 0.11865 1.04909
7 3.42E-11 43.922434 0.8387 0.12582 0.11621 518.94859
8 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
9 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
10 0.993717516 6.20E-05 0.8516 0.14839 0.11865 1
11 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
12 1 0 0.69073 0.12412 0.11458 1
13 1 0 0.6942 0.12096 0.11862 1.20916
14 1 0 0.70098 0.1214 0.11862 1.05347
15 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
16 0.625942013 0.237604 0.70371 0.12262 0.11865 1.12316
17 1 0 0.30086 0.05619 0.10976 1
18 1.70E-12 49.80162 0.83059 0.09738 0.11719 146.51077
19 0.010178788 6.603336 0.83919 0.14111 0.11848 999
20 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
21 1 0 0.53537 0.09578 0.11454 1
22 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
23 0.6663122 0.185568 0.77072 0.13927 0.11378 5.51208
24 1 0 0.727 0.12965 0.11646 1
25 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
26 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
27 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
28 4.37E-05 16.704412 0.83602 0.15333 0.1199 999
29 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
30 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
31 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
32 1 0 0.70563 0.12296 0.11865 1.08115
33 0.460406603 0.544906 0 0 0.11556 140.21885
34 0.994358151 5.00E-05 0.70444 0.12275 0.11865 1.06825
35 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
36 1 0 0.70412 0.12269 0.11865 1.05
37 1 0 0.70542 0.12292 0.11865 1.05032
38 1 0 0.85161 0.14839 0.11865 1
39 1 0 0.69477 0.12223 0.11202 1
40 1 0 0 0 0.10345 1
41 1 0 0.74051 0.12707 0.11695 1
42 1 0 0.73126 0.12428 0.11865 1

Summary statistics generated for each foreground branch using a Branch-site test. Branches in bold and italics are statistically significant with a dN/dS ratio greater than 1. Compare foreground branches with Figures 8, 9.

Lawson et al.

Lawson et al. BMC Evolutionary Biology 2012 12:202   doi:10.1186/1471-2148-12-202

Open Data